Han var henved de firs, da han blev pave, men nåede dog at føre et rædselsregime, der gav ham tilnavnetil terribile (= den frygtelige). Som en af de mest forhadte paver i nyere tid, reorganiserede haninkvisitionen, og skal have udtalt: "Hvis jeg opdagede, at min egen far varkætter, ville jeg med glæde slæbe tømmer til det bål, som jeg ville lade ham brænde på." Han indførte ligeledesIndex librorum prohibitorum, en fortegnelse over bøger, denkatolske kirke ikke vil godtage.
Ved sin død var Paul så forhadt, at mængden gik til angreb på hansstatue påKapitol. Den blev halshugget, og hovedet smidt iTiberen. Han blev derfor begravet i største hemmelighed iPeterskirkenskrypt. Først i1566, da det hele var kommet lidt på afstand, blev han gravlagt i familiekapellet i kirken S. Maria sopra Minerva.[1]