Som pave sluttede Julius 3. sig til kejserens politik og sammenkaldte på ny koncilet i Trient i1551, men da Karl 5. måtte flygte forMoritz af Sachsen, sluttede Julius våbenstilstand medFrankrig og hævede koncilet i Trient. For at fåEngland til at godkendepavens overherredømme efterMaria den Blodiges genindførelse af katolicismen tillod han den engelskeadel at beholde det beslaglagte kirkegods.[2]
Julius 3. understøttedekunst ogarkitektur, herunder opførelsen afVilla Giulia i Rom.[3] Imidlertid blev hans eftermæle i høj grad præget af hans skandaleombruste og langvarige forhold til ennapolitansk gadedreng ved navn Innocenzo. Som 18-årig blev den unge mand af Julius udnævnt til kardinal og sat i spidsen for den pavelige forvaltning, hvilket han viste sig komplet uduelig til. Senere blev Innocenzo anklaget formord ogvoldtægt og blev indespærret i etkloster.[4]
