Byen var grundlagt somTheodosia (Θεοδοσία) af græske kolonister fraMilet i 600 f.v.t. Byen blev i datiden kendt for sin frugtbare landbrugsjord, som handlen i området afhang af. Theodosia blev udplyndret afHunnerne i år 400. Herefter forblev Theodosia en mindre landsby i næsten 900 år. Byen har været under indflydelse afKhzazarene ogDet Byzantinske Rige.
Ligesom resten af Krim blev området også besat afkiptjakkerne og blev erobret afmongolerne i 1230'erne.
Sidst i det 13. århundrede ankom købmænd fraRepublikken Genova og købte byen fraDen Gyldne Horde. Her etablerede de en blomstrende handelspost kaldetKaffa, som principielt kom til at monopolisere handel i Sortehavsregionen. Kaffa kom til at huse en afEuropas størsteslavemarkeder. Fra 1266 og frem blev byen styret af en genovanskkonsul, som siden 1316 også styrede over alle Genovas sortehavskolonier. Mellem 1204-1261 og igen mellem 1296-1307 var byen underRepublikken Venedigs herredømme.
Ibn Battuta besøgte byen og bemærkede at det var "en ædel by ved kysten, beboet af kristne, hvoraf de fleste fra Genova". Han fortalte også: "Vi gik ned til havnen, og så en vidunderlig havn med omkring 200 fartøjer, både små og store, da det er en af verdens lovpriste havne."
I begyndelsen af 1318 etableredePave Johannes 22. en katolsk kirke i byen. Den første biskop for Kaffa var Fra' Gerolamo, under Republikken Genova. Efter at byen blev erobret afosmannerne i 1475, flyttede biskoppens residens også ud af byen.
Kaffa blev også, som resten af Europa, ramt afDen Sorte Død i 1374, og der er forlydender om, at pesten ramte Den Gyldne Horde (mongolerne), der var med til at sprede pesten til resten af regionen. Byen og området kom sig dog efterfølgende. Den kulturelt mangfoldige og blomstrende by blev efter Den Sorte Død beskrevet af den spanske omrejsendePedro Tafur i 1430'erne. I 1492 placerede Kaffa sig under beskyttelse afKasimir 4. Jagiellon af Polen.
EfterKonstantinopels fald blev Kaffas position uholdbar og tiltrak den osmanniske sultanMehmed 2.s opmærksomhed. Sultanen ville stoppe den genovanske indflydelse i Sortehavet. I 1473 dødetudun'en (eller guvernøren) afKrim-khanatet, og der blev kamp om at udnævne den afdøde guvernørs efterfølger. De genovanske myndigheder blandede sig i kampen, og efter atKrimtatarerne bad sultan Mehmed 2. om hjælp til at afgøre stridigheden, blev der udsendt en flåde, der forlod Konstantinopel den 19. maj 1475. Flåden forankrede sig uden for byens mure den 1. juni og påbegyndte bombardement af byen den næste dag. Indbyggerne i Kaffa kapitulerede til osmannerne den 6. juni, og flere blev tvunget til at forlade byen. Byen blev efterfølgende omdøbt tilKefe, og blev en af de vigtigste tyrkiske havne ved Sortehavet.
Under ledelse afPetro Konasjevytj-Sahajdatjnyij udslettedezaporogkosakkerne den tyrkiske flåde i 1615 og erobrede byen. Efter erobringen frigav kosakkerne de mænd, kvinder og børn, der var holdt som slaver i byen.
Den osmanniske kontrol over byen ophørte daDet Russiske Kejserrige erobrede hele Krimhalvøen i 1783. Byen blev herefter omdøbt til Feodosija (Ѳеодосія), efter den traditionelle russiske oversættelse af det antikke græske navn Theodosia.
Feodosija blev besat af tropper fraNazi-Tyskland iAnden Verdenskrig, og byen blev hårdt ramt i krigstiden.
Det moderne Feodosija er i høj grad en ferieby, som derfor har en del virksomheder, der fokuserer påturisme. Byen ligger tæt ved strande og et rigt naturliv. Ligeledes er der placeret spa- og wellnesscentre i byen. Udover turismefaciliteter hviler byens økonomi på landbrug og fiskeri. Den lokale industri inkludere blandt andet fiskeri,brygning ogkonservering af fødevarer.
Som på det meste af Krimhalvøen er de fleste indbyggere russere. Det ukrainske sprog bliver sjældent benyttet.
Ved Feodosija ligger Golden Beach (Zolotoy Pljasj) som består af små muslingeskaller, i modsætning til hovedparten af strandene på Krim, der består af småsten.
I vintermånederne er byen tyndt befolket; de fleste caféer og restauranter er lukkede. Erhvervs- og turistsæsonen begynder i midt-juni og peaker i juli og august. Som i de fleste andre resortbyer på Krimhalvøen kommer turisterne primært fra de gamleSovjet-lande. Populære turistmål er blandt andet det genovanske fort.
.svg)
