Atol das Rocas har en oval form og er 3,7 km lang og 2,5 km bred. Atollen består hovedsageligt afkoraler ogrødalger. Koralringen er næsten lukket med en 200 meter bredkanal på nordsiden og en meget smallere kanal på vestsiden.Lagunen er op til 6 meter dyb og har et areal på 7,5 km². Landarealet er på til sammen 0,36 km². Dette består af to småøer på vestsiden, Cemitério og Farol Cay. Det højeste punkt er en seks meter høj sandbanke på den sydlige del af Farol Cay. På begge småøer vokser dergræs, buske og nogle fåpalmer.Dyre- oginsektlivet består af blandt andetskildpadder,krabber,sandlopper, storekakerlakker og forskelligefuglearter. I søen rundt om atollen leverhajer ogdelfiner.
Forrest det gamle fyr og i baggrunden det nye
På Farol Cays nordlige del ligger etfyrtårn, som tilhører Brasiliens kystvagt. Fyret har været i drift siden begyndelsen af 1960'erne. Tæt ved siden af ligger ruinerne af et tidligere fyrtårn fra1933.
Atol das Rocas og søområderne rundt om er i dag et 320 km² stort marinbiologisk reservat. Siden2001 har reservatet været klassificeret somverdensarv sammen med øenFernando de Noronha.