V obdobíŘímské říše byl založen přístavPortus Victoriae Iuliobrigensium. Název města je zkomoleninou jména římského legionáře a křesťanského mučedníka Emeteria (San Emeter), který byl spolu se svým bratrem Celedoniem umučen kolem roku 300. Později oblast osídliliVizigóti. Za vlády králeAlfonse VIII. Kastilského přístav v Santanderu získal privilegia námořní i obchodní. V roce 1248 dostal také vlastní znak. Ve 13. století již existovala obě sídelní centra „staré město“ (s hradem a kolegiátní kapitulou při starším opatství, na místě katedrály) a „nové město“ s konventem sv. Františka a sv. Kláry. Město bohatlo především z námořního obchodu a v raném novověku patřilo k nejdůležitějším v Kastilii.
V letech 1881–1931 město patřilo k oblíbeným letoviskům španělského králeAlfonse XIII..
Město utrpělo dvě zásadní tragédieː V listopadu roku 1893 explodovalo 51 tun dynamitu na palubě lodi Cabo Machichaco v přístavu. 590 osob přišlo o život a stovky dalších o přístřeší, protože domy v přístavu byl zdemolovány. V roce 1941 město utrpělo válečným požárem, který vlivem silného větru zachvátil také historické centrum a jeho architektura zůstala v ruinách.
Katedrála Nanebevzetí Panny Marie, současná stavba stojí na starších základech. Z přelomu 12./13. století se dochovala trojlodní románsko-gotická krypta, v níž jsou v relikviářích vystaveny ostatky patronů města, svatých Emeteria a Celedonia. Po požáru z roku 1941 z§ůstala stát holá stavba bez oken a vnitřního zařízení, po válce byla plně rekonstruována.
Kostel Panny Marie v místní části Cueto, z kmenných bloků středověkého původu
Radnice – novogotická stavba
El Sardinero – nejstarší lázně a turistická čtvrť podél moře; první turisté přijížděli od roku 1850; proslavily je pobyty královnyIsabelly ll. (1861) a králeAmadea I. (1872), poté následovala výstavba hotelů, hostinců a zábavních podniků.
Palacio de la Magdalena – palác či zámek s věží v historizujícím stylu, dominanta na návrší poloostrova La Magdalena; byl postaven roku 1909 jako dar obyvatel města královské rodině Alfonse XIII.
Palacete del Embarcadero – přístavní palác v eklektickém stylu; postaven počátkem 20. století jako terminál pro cestující.
PalácBanco Santander – hlavní sídlo významné španělské a světové banky, symbol ekonomické prosperity města
Mercado de la Esperanza – kamenná patrová tržnice z roku 1904
Placa Porticada; náměstí se třemi veřejnými budovami v historizujícím stylu (sídlo regionální vlády Kantábrie); architektura je inspirovaná budovoucelnice, která stávala na tomto místě do roku 1893.
Pomník Pedra Velarde Y Santiliána (1779–1808) na náměstí Placa Porticada; bronzový pomník španělskému vojáku, který padl při obraně Madridu předNapoleonem; pomník z roku 1880
El Faro de Cabo Mayor – historický maják na útesu ve velkém zálivu
Museo de Prehistoria y Arqueología de Cantabria (Muzeum pravěku a archeologie)
Museo Marítimo del Cantábrico (Námořní muzeum)
Museo de Arte Moderno y Contemporáneo (Muzeum moderního a současného umění), založeno roku 1908, ze španělských malířů jsou zastoupeni mj.Francisco Goya aPablo Picasso.
Centro Botin je multikulturním střediskem se sály konferenčním, výstavním a divadelním, jeho moderní architekturu navrhl Renzo Piano roku 1972.Téhož roku byla v Santanderu založena univerzitaUniversidad de Cantabria, která má v současnosti pět fakult a několik institutů, také v jiných městech.[2]