Cílem OAJ bylo zajištění jednoty a vzájemné solidarity afrických zemí při zachování jejich suverenity a integrity a neovlivnitelnosti jejich vnitřních záležitostí. OAJ měla zastupovat africké země i na mezinárodní scéně a přispívat k odstraněníkolonialismu z tohoto světadílu.
Původní záměr vybudování nadstátní organizace se silnými pravomocemi se nakonec neuskutečnil, význam OAJ se tak postupně zmenšoval. Přesto však organizace zaznamenala některé úspěchy, v roce1964 např. prohlásila Afriku za bezjadernou zónu.
Charta OAJ obsahovala ustanovení týkající se zprostředkování míru, usmíření aarbitráže. 29. zasedání hlav států a vlád vKáhiře v roce1993 navíc přijalo usnesení o vzniku Mechanismu prevence, usměrňování a řešení konfliktů, který měl zajišťovat plnění úkolů peace-building a peace-making. Reálné výsledky tyto iniciativy ovšem přinejmenším v době existence OAJ nepřinesly. Jednotky OAJ byly poprvé nasazeny vČadu v roce1981; vždy úzce spolupracovaly s mírovými sboryOSN. Přestože na počátku 90. let OAJ působilo i veRwandě, nepodařilo se jí nijak přispět k zamezení genocidy; v dubnu1994, kdy byly rozpoutány masakry, OAJ ostatně již zcela nahradila mise OSNUNAMIR. Neschopnost OAJ účinně zasáhnout proti rýsujícím se hrozbám ovšem plně ilustrovalo její angažmá vBurundi, kde atentát na prezidentaMelchiora Ndadaye dne 22. října 1993 zavdal k rozpoutání obdobných masakrů mezi Hutuy a Tutsii, jaké zažila o půl roku později sousední Rwanda. 19. listopadu 1993 rozhodla OAJ o vyslání 5000 vojáků v rámci miseMIPROBU (Mission for the Protection and Reestablishment of Confidence in Burundi). Tento plánovaný kontingent byl nicméně vzápětí zredukován na 180 vojáků a 20 civilních zaměstnanců. OAJ byla nakonec schopná do Burundi vyslat 47 vojáků pozorovatelské miseMIOB (International Burundi Observer Mission) a to teprve v roce1995.
Mezi orgány OAJ náleželaKonference nejvyšších představitelů členských států, scházející se minimálně jednou do roka, dáleRada ministrů OAJ, složená z ministrů zahraničí členských zemí a scházející se dvakrát do roka, aGenerální sekretariát OAJ, který byl umístěn v Addis Abebě. Pracovními jazyky OAJ se stalaangličtina afrancouzština.