Společnost byla založena pod názvem „Nintendó Koppai“23. září roku 1889Fusadžiró Jamaučim a její hlavní náplní byla výrobahracích karet pro hru zvanouHanafuda. Ručně vyráběné hrací karty se staly oblíbenými, a tak Jamauči najal další zaměstnance pro zvýšení výroby. Později společnost organizovala i vlastní karetní turnaje.
V roce1956Hiroši Jamauči (pravnuk Fusadžiró Jamaučiho) navštívil obchodněSpojené státy americké kvůli jednání s United States Playing Card Company, dominantní společností s hracími kartami v severní Americe. Při jednání si všiml, že největší společnost v jeho odvětví sídlí pouze v malé kanceláři, a to byl hlavní bod k jeho akceleraci v obchodu s hracími kartami. Zároveň se mu podařilo získat možnost dávat na své karty postavyspolečnosti Disney.
Od roku1963 společnost Nintendó začala experimentovat i v jiných odvětvích. Většina pokusů, jako prodej instantnírýže, však skončila neúspěchem. Nadále se společnost orientovala pouze na zábavní systémy, jako například měřič lásky Nintendo Love Tester.
Roku1977 byl do společnosti přijat vedoucí studentského projektuŠigeru Mijamoto, jehožDonkey Kong, vydaný roku1981 získal ohromný úspěch. Navíc prodej licencí pro jiné systémy znamenal pro Nintendo značný nárůst zisku. Ještě roku1980 Nintendo začalo s prodejem vlastní digihryGame & Watch.
Za další klíčový rok je považován1985, kdy na severoamerický trh doraziloNintendo Entertainment System (zkráceně NES), který doprovázela dnes velmi známá hraSuper Mario Bros. Tehdy se již ale objevil konkurenční systémMaster System od společnostiSEGA. Roku1989 pak přišlo Nintendó s přenosnou herní konzolí zvanouGame Boy.
8bitový NES byl později nahrazen další domácí konzolíSuper Nintendo Entertainment System (SNES), která disponovala již 16bitovým systémem a opět musela na trhu bojovat proti firmě SEGA a jejímuMega Drive.Nintendo 64 bylo zmiňováno hlavně s jeho schopnostmi 3D grafiky a rozšíření počtu hráčů ze standardních dvou až na čtyři.
První konzolí, která využívalaoptické disky namísto plastovýchcartridgí, bylaNintendo GameCube.
Následovníkem GameCube se stalo NintendoWii. Wii patří do tzv. 7. generace herních konzolí. Oproti konkurentům – PlayStationu od Sony a Xboxu od Microsoftu – se vydalo cestou interaktivní zábavy a pokrokovým ovladačem, nazvaném Wii Remote, jehož pohyb zachycuje senzor a převádí ho do hry. Tuto technologii později použil také Microsoft se svým Kinectem a Sony s PlayStation Move.
Následovníkem Wii je v roce 2012 vydané Wii U, které s Wii Remotem přineslo také displej zabudovaný v ovladači, díky čemuž je možné se např. dívat do displeje v ovladači, jako do zaměřovače, zatímco na monitoru vidět obyčejný pohled. Wii U je zástupce tzv. 8. generace konzolí, kde konkuruje PlayStationu 4 a Xboxu One.