Koncem roku 2004 mu strýc domluvil zkoušku veWisłe Kraków, kde zaujal tehdejšího trenéraVernera Ličku. Ten si všiml jeho talentu a angažoval jej. V Ekstraklase debutoval 20. března 2005 proti celkuPolonia Warszawa (výhra 3:1) a záhy se probojoval do základní sestavy. Na konci sezóny slavil s mužstvem titul. Následující ročník 2005/06 se Wisła umístila v lize na druhé příčce. Celkem za Wisłu odehrál v polské nejvyšší ligové soutěži 51 utkání a vstřelil 3 branky.
V únoru 2007 bylo oznámeno, že Jakub po skončení sezóny 2006/07 odejde do německéBorussie Dortmund (za nespecifikovanou částku). Zde podepsal čtyřletý kontrakt. V sezóně 2010/11 získal s Borussií bundesligový titul, který následně se spoluhráči obhájil v sezóně 2011/12. V tomto ročníku navíc vyhrál iDFB Pokal, ve finále Borussia zvítězila 5:2.[4][5]
V odvetném utkání osmifináleLigy mistrů 2012/13 5. března 2013 protiŠachtaru Doněck se gólem podílel na výhře 3:0 a postupu do čtvrtfinále.[6] V prvním zápase Borussie v semifináleLigy mistrů 2012/13 24. dubna 2013 protiRealu Madrid odehrál stejně jako jeho spoluhráči vydařený zápas, Borussia zvítězila 4:1 a vytvořila si dobrou pozici do odvety.[7] S Dortmundem se představil 25. května 2013 veWembley ve fináleLigy mistrů proti rivaloviBayernu Mnichov, Borussia však nejprestižnější evropský pohár nezískala, podlehla Bayernu 1:2. Błaszczykowski nastoupil do utkání v základní sestavě.[8]
27. července 2013 na začátku sezóny 2013/14 nastoupil v utkáníDFL-Supercupu (německý fotbalový Superpohár) protiBayernu Mnichov na domácím stadionuSignal Iduna Park, Borussia vyhrála 4:2 a získala trofej.[9] 25. ledna 2014 se v bundesligovém zápase protiFC Augsburg (remíza 2:2) zranil, odnesl to přední překřížený vaz v pravém koleni. Hráč musel na operaci a sezona pro něj skončila.[10]
Zúčastnil seMistrovství Evropy 2012, kde mělo Polsko jako pořadatelská země (společně s Ukrajinou) jistou účast. V zahajovacím utkání celého šampionátu 8. června se střetlo Polsko s Řeckem a Jakub přihrával v 17. minutě na první gól turnajeRobertu Lewandowskému. Na tři body to nestačilo, oba soupeři si připsali po bodu za remízu 1:1.[15] 12. června se opět zrodila remíza 1:1 polského národního mužstva sRuskem, Błaszczykowski vsítil jedinou branku svého týmu.[16] V přímém souboji o čtvrtfinále s Českou republikou 16. června pohřbil polské naděje na historicky první postup ze základní skupiny jediným gólem utkání českýzáložníkPetr Jiráček.[17] Polsko obsadilo se ziskem 2 bodů poslední čtvrté místozákladní skupiny A.[18]
↑Janas: Błaszczykowski i Janczyk mogli jechać na mundial [online]. pilka.pl [cit. 2013-05-02].Dostupné v archivu pořízeném dne 26-12-2013. (polsky)Je zde použita šablona{{Cite web}} označená jako k „pouze dočasnému použití“.