Virus SARS-CoV-2 adalah virus RNA yang sering mengalami mutasi, namun sejak awal tahun 2022 sehingga kini, tiada varian baharu selain Omicron yang dikesan di Malaysia. Namun, beberapa subvarian Omicron seperti XBB, BA.5, BA.2.86, KP.2, dan JN.1 telah dikenal pasti. Setakat ini, kesemua subvarian ini tidak menunjukkan bukti menyebabkan komplikasi penyakit yang lebih teruk.
Kementerian Kesihatan Malaysia akan meneruskan survelan genomik bagi COVID- 19 untuk pengesanan awal sebarang varian baharu.