A l'hora de declarar-se la independència de l'arxipèlag, en va ser l'única illa que en el referèndum de1974 va votar a favor de continuar sota domini francès.[2] Les Comores, però, en reclamen la sobirania. Una resolució del Consell de Seguretat de lesNacions Unides de1976 va donar suport a aquesta reclamació per una majoria d'11 dels seus 15 membres; ara bé, com que França va vetar el dictamen, no es va aprovar. Aquesta situació es va repetir l'any2004.
La situació de Mayotte sembla de difícil solució per a l'Estat francès: mentre que la població local ha demostrat llargament que vol continuar mantenint els lligams amb França i no unir-se a les Comores, s'han aixecat veus internacionals de protesta contra aquesta situació de dependència. A més a més, la peculiar administració local de Mayotte, que tradicionalment aplica la llei islàmica, és difícil d'integrar dins les estructures legals franceses, això per no esmentar el cost que representa fer que el nivell de vida de Mayotte s'assembli als estàndards de laFrança europea. A causa de tot plegat, les lleis del Parlament francès han d'especificar clarament que són d'aplicació a Mayotte si realment volen ser-hi efectives.
L'estatut polític de Mayotte es va canviar el2001, de manera que ara és més semblant al delsdepartaments de la França continental: ara és anomenada una "col·lectivitat departamental"; això malgrat que lesComores en continuen reclamant la sobirania. Aquest canvi d'estatus va ser aprovat pel 73% de la població de Mayotte en referèndum.
El 2011 Mayotte deixà l'estatus de col·lectivitat departamental d'ultramar i esdevingué un departement oregió d'ultramar.
L'illa principal, Mahoré (oGrand Terre), amb 362 km² i 159.042 habitants el2005, és la més meridional de les Comores, i geològicament és la més antiga de l'arxipèlag. Té 39 km de llarg i 22 d'amplària, i els punts més elevats es troben entre els 500 i els 600 metres sobre el nivell del mar. Com que és de natura volcànica, el sòl hi és relativament fèrtil en algunes àrees determinades. L'escull coral·lí que encercla una bona part de l'illa ofereix refugi als vaixells i un bon hàbitat per als peixos.
Dzaoudzi va ser la capital de les Comores fins al 1962 i fins no fa gaire va ser el centre administratiu de Mayotte, traslladat ara aMamoudzou, a l'illa principal. Dzaoudzi, amb 14.141 habitants el2005, la segona ciutat del territori i el port principal, se situa a l'illa de Pamanzi (oPetite Terre), que amb vora 11 km² i 23.033 habitants és la més gran de les diverses illes adjacents a Mahoré, a la qual la uneix una carretera sobre undic.
Nota:Aquestes grans regions africanes són merament indicatives. Alguns estats, situats en zones de transició, poden incloure's en una regió o en una altra atenent criteris diferents. VegeuLlista d'estats independents i territoris dependents