El seu nom oficial és Estella ("estel") encastellà i Lizarra ("terra defreixes") enèuscar. Antigament el poblat rebia el nom de Lizarra, fins a la creació de la ciutat en1076. Sovint a la col·lecció diplomàtica delMonestir d'Iratxe apareixen referències a aquest poblat anomenat, segons els casos,Leizarrara,Lizarrara,Liçarrara,Lizarara,Liçarra i Lizarra. El topònim, inequívocament en llengua basca, en algunes ocasions s'ha interpretat com ailizar, que vol dir "ciutat antiga" i, també, com aelizar, que vol dir "església antiga". No obstant això, sembla més probable l'etimologializar, que vol dir "freixe" en èuscar, per l'abundància d'aquest tipus d'arbre a les vores delriu Ega.
El nom d'Estella procedeix destella (estel), i s'estableix en el moment de la fundació de la ciutat pel Rei de Navarra Sanxo Ramírez, com a punt d'atenció per al peregrí al seu pas pel tram navarrès delCamí de Sant Jaume (Campus Stellae). Hi ha diverses referències a la denominació del'izarra, portada per habitants d'origen franc, i que pot també donar origen a aquest nom. Aquest terme "izar" o "izarra" en èuscar també es tradueix en català com a "estel". De fet, la presència d'unestel de vuit puntes en els monuments de la ciutat es remunta al seu estadi fundacional, punt que sembla fer testimoni d'aquesta etimologia. L'estel ha romàs fins a l'actualitat com a senyal distintiu de la ciutat.
Rocamador, San Pedro, San Miguel, San Juán, Remontival, Plaza de Toros y Yerri, Zaldu, El Puy, El Volante, Zalatambor, Lizarra, Navarrería, Calle Mayor, Valdelobos, Pza. Santiago, San Benito, Sector-B, Merkatondoa, San Cristóbal i Fuente de la Salud.
