Config.sys és l'arxiu principal de configuració en elssistemes operatiusMS-DOS iOS/2 (Sistema operatiu d'IBM que pretenia ser el successor de MS-DOS). Aquest arxiu conté instruccions necessàries per a iniciar o configurar tot el sistema. Després de processar el fitxer config.sys, s'executa i es carrega laconsola, des de la qual es pot executar l'arxiuautoexec.bat.