SYNM
Identifikatori
Aliasi	SYNM
Vanjski ID-jevi	OMIM:606087MGI:2661187HomoloGene:9081GeneCards:SYNM
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 15 (čovjek)[1] Bend 15q26.3 Početak 99,098,217bp[1] Kraj 99,135,593bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 7 (miš)[2] Bend 7|7 C Početak 67,379,908bp[2] Kraj 67,409,490bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija •vinculin binding •GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine •structural molecule activity •intermediate filament binding •structural constituent of cytoskeleton •structural constituent of muscle Ćelijska komponenta •citoplazma •međućelijske veze •Kostamera •membrana •citoskelet •Intermedijarni filament •adherens junction •neurofilament cytoskeleton •Sarkolema Biološki proces •intermediate filament cytoskeleton organization •fast-twitch skeletal muscle fiber contraction Izvori:Amigo /QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	23336	233335
Ensembl	ENSG00000182253	ENSMUSG00000030554
UniProt	O15061	Q70IV5
RefSeq (mRNK)	NM_145728 NM_015286	NM_183312 NM_201639 NM_207663
RefSeq (bjelančevina)	NP_056101 NP_663780	NP_899135 NP_964001 NP_997546
Lokacija (UCSC)	Chr 15: 99.1 – 99.14 Mb	Chr 7: 67.38 – 67.41 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Sinemin, znan i kaodezmuslin, jeprotein koji je kodljudikodirangenomSYNM.^[5] Sinemin je član porodice proteinsa saintermedijarnim filamentima (IF). Ako su proteinicitoskeletni proteini koji pružaju otpornost na mehanički stres, kodirani su iz raspršene multigenske porodice. Utvrđeno je da ovaj protein stvara vezu izmeđudezmina, koji je podjedinica IF mreže, ivanćelijskog matriksa i pruža važnu strukturnu potporu u mišićima.

Hibridizacijskom analizom zračenja, Nagase i sur. (1997) locirali su gen SYNM nahromosomu 15.^[6]

Gross (2019) je precizirao poziciju lokusa SYNM na hromosomsku sekvencu 15q26.3, na temelju poravnanja sekvence SYNM-a (GenBank BC151243) sagenomskom sekvencom (GRCh38).^[7]

Sekvenciranjem nasumično odabranihcDNK koje odgovaraju relativno dugim transkriptima iz ljudskog mozga, Nagase et al. (1997) identificirali sucDNK i nazvali je KIAA0353, koja kodira izvedeni protein od 1.374 aminokiselina.

Korištenjem 2-hibridnog pristupa kvasca za traženje proteina koji stupaju u interakciju s alfa-distrobrevinom, Mizuno et al. (2001) identificirali su isti protein, koji su nazvali desmuslin (DMN). Analiza sekvence pokazala je da DMN ima kratkiN-terminalni domen, konzervirani domen štapića i dugiC-terminalni domen, sve zajedničke karakteristike intermedijarnog proteina tipa VI. Pozitivna interakcija između DMN i alfa-distrobrevina potvrđena jein vitro testom koimunoprecipitacije. AnalizomNorthern blot-a, Mizuno et al. (2001) otkrili su da se transkript DMN od 7,5 kb eksprimira uglavnom usrcu iskeletnim mišićima, iako postoji određena ekspresija umozgu.Western blot analiza otkrila je protein od 160 kD u srcu i skeletnim mišićima.^[8]

Imunofluorescentna mikroskopija lokalizirala je DMN prugastim uzorkom u uzdužnim presjecima i mozaičnim uzorkom u presjecima skeletnih mišića.Elektronskomikroskopska analiza pokazala je da se DMN kolokalizira s dezminom na Z-linijama. Naknadni eksperimenti s koimunoprecipitacijom potvrdili su interakciju s dezminom. Mizuno i dr. (2001) sugeriraju da DMN može poslužiti kao izravna veza izmeđuvanćelijskog matriksa i Z-diskova, putem plektina i može imati važnu ulogu u održavanju integriteta mišićnih ćelija.

Dužinapolipeptidnog lanca je 1.565aminokiselina, amolekulska težina 172.768Da.^[9].

Simboli

Sinemin jeintermedijarni filament (IF) i, kao i drugi IF, primarno funkcionira kao integrirajući mehanički stres i održavajući strukturni integritet ueukariotskim ćelijama. Iako je primijećen u različitim tipovima ćelija, najbolje je proučavan usarkomerama skeletnihmiocita. Lokalizira se na Z-disku i pokazano je da se veže zaα-distrobrevin,α-aktinin idezmin, da djeluje kao mehanički linker u prenošenjusila bočno kroztkivo, posebno između kontraktilnihmiofibrila ivanstaničnog matriksa. Sinemin doprinosi povezivanjukostamera i kontraktilnog aparata u skeletnim mišićima sinemin nulživotinja.^[10] Synemin plays an important regulatory role in the heart and the consequences of its absence are profound.^[11]

Sinemin ima svojstva vrlo slična intermedijarnom filamentusinkoilina. Konkretno, veže se za α-distrobrevin udistrofinom povezanomproteinskom kompleksu da djeluje kao mehanički "linker" između miofibrilske mreže ićelijske membrane.^[12]

Postoje trivarijante prerade sinemina, α i β i L. Objeizoforme imaju vrlo kratkiN-terminalni domen od 10 aminokiselina i dugiC-terminalni domen od 1243aminokiseline za izoformu-α i 931 aminokiseline za izoformu-β.^[13] Anintronic sequence of the synemin β isoform is used as a coding sequence for synemin α.^[13][14]

Gen SYNM je posmatran kako se progresivno smanjuje uljudskii papiloma virus – pozitivanneoplazijski keratinocit izveden izcerviksa maternicepreneoplazijske lezije na različitim nivoima malignosti.^[15] Zato je SYNM vjerovatno povezan s tumorigenezom i može biti potencijalni prognostički marker za napredovanje cerviksne preneoplazijskelezije.^[15]

Porijeklo konvencije o imenovanju sinemin/desmuslin prilično je složeno. U 1980. sinemin je prvi put identifikovan uptičjimglatkim mišićima i u početku je opisan kao protein povezan s IF, zbog njegove kolokalizacije i prečišćavanja sadezminom ivimentinom.^[16] Nakonkloniranja kokošijeg sinemina, Mizunoet al. izvijestili su o kloniranju novog IF proteina, ljudskog dezmuslina, kao proteina koji djeluje s α-distrobrevinom.^[12] Analiza sekvence pokazala je da je ljudski dezmuslin bio 32% identičan i 11% sličanaminokiselinskoj sekvenci kokošijeg sinemina, dok su IF proteinivimentin idezmin više od 80% identični kod iste vrste. Iako je nekoliko dijelova bilo vrlo slično između ljudskog dezmuslina i kokošijeg sinemina, nizak stupanj konzerstiviranosti između ova dva proteina u usporedbi s drugim kloniranim IF proteinima sugerirao je da sinemin nije ljudskiortolog dezmuslina. Pored toga, za razliku od kokošijeg sinemina, testoviin vitrokoimunoprecipitacija nisu mogli otkriti interakciju između ljudskog dezmuslina i α-aktinina.^[12] U 2001., Titeux et al. izvestili su o kloniranju α i β varirajućeizoforme ljudskog sinemina i pokazale su da je β-sinemin identičan desmuslinu.^[13] 2014. godine prijavljena je prva sinemin – /– nula životinja.^[10]

• Synemin naUS National Library of MedicineMedical Subject Headings (MeSH)

• Geni na hromosomu 15
• Ljudski proteini
• Proteomika