Movatterモバイル変換


[0]ホーム

URL:


Idi na sadržaj
WikipediaSlobodna enciklopedija
Pretraga

SPINK5

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
SPINK5
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa:PDBeRCSB
Spisak PDB ID kodova

1H0Z,1HDL,1UUC,1UVF,1UVG

Identifikatori
AliasiSPINK5
Vanjski ID-jeviOMIM:605010MGI:1919682HomoloGene:4987GeneCards:SPINK5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za SPINK5
Genomska lokacija za SPINK5
Bend5q32Početak148,025,683bp[1]
Kraj148,137,382bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 18 (miš)
Hrom.Hromosom 18 (miš)[2]
Hromosom 18 (miš)
Genomska lokacija za SPINK5
Genomska lokacija za SPINK5
Bend18 B3|18 23.74 cMPočetak44,096,302bp[2]
Kraj44,155,568bp[2]
ObrazacRNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcijapeptidase inhibitor activity
serine-type endopeptidase inhibitor activity
Ćelijska komponentacitoplazma
citosol
endoplasmic reticulum membrane
cell cortex
Endoplazmatski retikulum
perinuklearno područje citoplazme
epidermal lamellar body
extracellular region
intracellular membrane-bounded organelle
Biološki procesepidermal cell differentiation
negative regulation of proteolysis
negative regulation of serine-type peptidase activity
negative regulation of peptidase activity
epithelial cell differentiation
hair cell differentiation
extracellular matrix organization
negative regulation of antibacterial peptide production
negative regulation of immune response
regulation of cell adhesion
negative regulation of angiogenesis
negative regulation of serine-type endopeptidase activity
regulation of T cell differentiation
cornification
regulation of timing of anagen
Izvori:Amigo /QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

11005

72432

Ensembl

ENSG00000133710

ENSMUSG00000055561

UniProt

Q9NQ38

Q148R4

RefSeq (mRNK)

NM_001127698
NM_001127699
NM_006846

NM_001081180

RefSeq (bjelančevina)

NP_001121170
NP_001121171
NP_006837

NP_001074649

Lokacija (UCSC)Chr 5: 148.03 – 148.14 MbChr 18: 44.1 – 44.16 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Srodni inhibitor limfo-epitelnog kazalskog tipa (LEKTI), poznat i kaoinhibitorserinskeproteaze Kazal-tip 5 (SPINK5) jestprotein koji je kodljudikodirangenomSPINK5 sahromosoma 5.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi |uredi izvor]

Dužinapolipeptidnog lanca je 1.064aminokiseline, аmolekulska težina 120.714Da.[7]

1020304050
MKIATVSVLLPLALCLIQDAASKNEDQEMCHEFQAFMKNGKLFCPQDKKF
FQSLDGIMFINKCATCKMILEKEAKSQKRARHLARAPKATAPTELNCDDF
KKGERDGDFICPDYYEAVCGTDGKTYDNRCALCAENAKTGSQIGVKSEGE
CKSSNPEQDVCSAFRPFVRDGRLGCTRENDPVLGPDGKTHGNKCAMCAEL
FLKEAENAKREGETRIRRNAEKDFCKEYEKQVRNGRLFCTRESDPVRGPD
GRMHGNKCALCAEIFKQRFSEENSKTDQNLGKAEEKTKVKREIVKLCSQY
QNQAKNGILFCTRENDPIRGPDGKMHGNLCSMCQAYFQAENEEKKKAEAR
ARNKRESGKATSYAELCSEYRKLVRNGKLACTRENDPIQGPDGKVHGNTC
SMCEVFFQAEEEEKKKKEGKSRNKRQSKSTASFEELCSEYRKSRKNGRLF
CTRENDPIQGPDGKMHGNTCSMCEAFFQQEERARAKAKREAAKEICSEFR
DQVRNGTLICTREHNPVRGPDGKMHGNKCAMCASVFKLEEEEKKNDKEEK
GKVEAEKVKREAVQELCSEYRHYVRNGRLPCTRENDPIEGLDGKIHGNTC
SMCEAFFQQEAKEKERAEPRAKVKREAEKETCDEFRRLLQNGKLFCTREN
DPVRGPDGKTHGNKCAMCKAVFQKENEERKRKEEEDQRNAAGHGSSGGGG
GNTQDECAEYREQMKNGRLSCTRESDPVRDADGKSYNNQCTMCKAKLERE
AERKNEYSRSRSNGTGSESGKDTCDEFRSQMKNGKLICTRESDPVRGPDG
KTHGNKCTMCKEKLEREAAEKKKKEDEDRSNTGERSNTGERSNDKEDLCR
EFRSMQRNGKLICTRENNPVRGPYGKMHINKCAMCQSIFDREANERKKKD
EEKSSSKPSNNAKDECSEFRNYIRNNELICPRENDPVHGADGKFYTNKCY
MCRAVFLTEALERAKLQEKPSHVRASQEEDSPDSFSSLDSEMCKDYRVLP
RIGYLCPKDLKPVCGDDGQTYNNPCMLCHENLIRQTNTHIRSTGKCEESS
TPGTTAASMPPSDE

Struktura i funkcija

[uredi |uredi izvor]

LEKTI je velikamultidomenskaserin-proteaza,inhibitor koji je eksprimiran u slojevitomepitelnom tkivu. Sastoji se od 15 domena koji se cijepaju na manje funkcionalne fragmente pomoću proteazefurina. Samo dva od ovih domena (2 i 15) sadrže po šest ravnomjerno raspoređenihcisteina, odgovornih za tri intramolekulskedisulfidne veze karakteristične zainhibitore povezane sa tipom Kazal . Preostali domen sadrže po četiri cisteina.<eef name="furio"/> Ove disulfidne veze prisiljavaju molekule na krutu konformaciju koja omogućava proteinu da stupi u interakciju s ciljanom proteazom putem proširenogbeta-lista. Svi domeni (osim 1, 2 i 15) sadržearginin na P1, što ukazuje da su vjerovatne mete proteaze sličnetripsinu.[8]

U epidermi, LEKTI je uključen u regulacijudeskvamacija, svojom sposobnošću da selektivno inhibiraKLK5,KLK7 iKLK14.[9] Puna dužinarecombinantnog LEKTI-ija inhibira egzogene serinske proteaze:tripsin,plazmin,subtilizin A,katepsin G i ljudskeneutrofilneelasteze.[10]

LEKTI može imati ulogu umorfogenezi kože idlaka i antiupalnoj i/ili antimikrobnoj zaštiti epitelasluzokoža.[6]

Gen

[uredi |uredi izvor]

SPINK5 je član klastera genske porodice koji se nalazi nahromosomu 5, regija q32,[11] koji kodiraju inhibitore serin-proteaza. Ovo uključuje i druge epidermne proteine,SPINK6 iLEKTI-2 (SPINK9). Gen "SPINK5" je dug 61 kb i sadrži 33egzona.[8]Alternativna preradaSPINK5 rezultira stvaranjem tri različita genska proizvoda, koji su identificirani u diferenciranimkeratinocitima.[12]

Klinički značaj

[uredi |uredi izvor]

Mutacije u genu SPINK5 rezultirajuNethertonovim sindromom, poremećajem koji karakteriziraihtioza i specifična oštećenjaimunoskog sistema.[6]

Reference=

[uredi |uredi izvor]
  1. ^abcGRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000133710 -Ensembl, maj 2017
  2. ^abcGRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000055561 -Ensembl, maj 2017
  3. ^"Human PubMed Reference:".National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^"Mouse PubMed Reference:".National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^Magert HJ, Standker L, Kreutzmann P, Zucht HD, Reinecke M, Sommerhoff CP, Fritz H, Forssmann WG (Aug 1999)."LEKTI, a novel 15-domain type of human serine proteinase inhibitor".J Biol Chem.274 (31): 21499–502.doi:10.1074/jbc.274.31.21499.PMID 10419450.
  6. ^abc"Entrez Gene: SPINK5 serine peptidase inhibitor, Kazal type 5".
  7. ^"UniProt, Q9NQ38" (jezik: engleski). Pristupljeno 20. 10. 2021.
  8. ^abFurio L, Hovnanian A (novembar 2011)."When Activity Requires Breaking Up: LEKTI Proteolytic Activation Cascade for Specific Proteinase Inhibition".J Invest Dermatol.131 (11): 2169–73.doi:10.1038/jid.2011.295.PMID 21997416.
  9. ^Deraison C, Bonnart C, Lopez F, Besson C, Robinson R, Jayakumar A, Wagberg F, Brattsand M, Hachem JP, Leonardsson G, Hovnanian A (septembar 2007)."LEKTI fragments specifically inhibit KLK5, KLK7, and KLK14 and control desquamation through a pH-dependent interaction".Mol. Biol. Cell.18 (9): 3607–19.doi:10.1091/mbc.E07-02-0124.PMC 1951746.PMID 17596512.
  10. ^Mitsudo K, Jayakumar A, Henderson Y, Frederick MJ, Kang Y, Wang M, El-Naggar AK, Clayman GL (april 2003). "Inhibition of serine proteinases plasmin, trypsin, subtilisin A, cathepsin G, and elastase by LEKTI: a kinetic analysis".Biochemistry.42 (13): 3874–81.doi:10.1021/bi027029v.PMID 12667078.
  11. ^"SPINK5 serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI".
  12. ^Tartaglia-Polcini A, Bonnart C, Micheloni A, Cianfarani F, Andrè A, Zambruno G, Hovnanian A, D'Alessio M (februar 2006)."SPINK5, the defective gene in netherton syndrome, encodes multiple LEKTI isoforms derived from alternative pre-mRNA processing".J Invest Dermatol.126 (2): 315–24.doi:10.1038/sj.jid.5700015.PMID 16374478.

Dopunska literatura

[uredi |uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi |uredi izvor]
PDB galerija

K0ategorija:Proteomika

Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=SPINK5&oldid=3388194"
Kategorije:
Sakrivena kategorija:

[8]ページ先頭

©2009-2025 Movatter.jp