Karboksipeptidaza (EC: 3.4.16 - 3.4.18) jeproteaznienzim kojihidrolizira (cijepa)peptidne veze nakarboksi-terminalnom (C-terminalnom) krajuproteina ilipeptida. Ovo je u suprotnosti sa djelovanjemaminopeptidaza, koje cijepaju peptidne veze naN-terminalu proteina.Ljudi,životinje,bakterije ibiljke sadrže nekoliko tipova karboksipeptidaza koje imaju različite funkcije u rasponu odkatabolizma do sazrijevanja proteina.
Karboksipeptidaze djeluju tako što zamjenjuju vodu supstrata karbonilnom (C=O) grupom.
Prve proučavane karboksipeptidaze bile su one koje su uključene uvarenje hrane (pankreasne karboksipeptidaze A1, A2 i B). Međutim, većina poznatih karboksipeptidaza nije uključena ukatabolizam; one pomažu sazrevanju proteina (npr.posttranslacijske modifikacije) ili regulišu biološke procese. Naprimjer, za biosintezuneuroendokrinih peptida kao što jeinsulin potrebna je karboksipeptidaza. Karboksipeptidaze također funkcionišu uzgrušavanju krvi, proizvodnjifaktora rasta,zarastanju rana,reprodukciji i mnogim drugim procesima.
Na osnovu mehanizma njihovogaktivnog mjesta, karboksipeptidaze se obično klasifikuju u jednu od nekoliko porodica.
Ovi nazivi se ne odnose na selektivnostaminokiseline koja se cijepa.
Drugi sistem klasifikacije za karboksipeptidaze odnosi se na njihovu preferencijusupstrata.
Metalokarboksipeptidaza koja cijepaC-terminalniglutamat od peptida N-acetil-L-aspartil-L-glutamata naziva se "glutamat-karboksipeptidaza".
Serinska karboksipeptidaza koja cijepaC-terminalni ostatak od peptida koji sadrže sekvencu -Pro-Xaa (Pro je prolin, Xaa je bilo kojaaminokiselina na C-terminalu peptida) naziva se "prolil-karboksipeptidaza".
Neke, ali ne sve, karboksipeptidaze se u početku proizvode u neaktivnom obliku; ovaj prekursorski oblik naziva seprokarboksipeptidaza. U slučajupankreasne karboksipeptidaze A, neaktivnizimogeni oblik – prokarboksipeptidaza A –pretvara se u svoj aktivni oblik – karboksipeptidazu A – pomoću enzimatripsina. Ovaj mehanizam osigurava da se ćelije u kojima se proizvodi pro-karboksipeptidaza A nesamoprobavljaju.