Movatterモバイル変換


[0]ホーム

URL:


Idi na sadržaj
WikipediaSlobodna enciklopedija
Pretraga

FXN

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
FXN
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa:PDBeRCSB
Spisak PDB ID kodova

1EKG,1LY7,3S4M,3S5D,3S5E,3S5F,3T3J,3T3K,3T3L,3T3T,3T3X

Identifikatori
AliasiFXN
Vanjski ID-jeviOMIM:606829MGI:1096879HomoloGene:47908GeneCards:FXN
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za FXN
Genomska lokacija za FXN
Bend9q21.11Početak69,035,751bp[1]
Kraj69,079,076bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 19 (miš)
Hrom.Hromosom 19 (miš)[2]
Hromosom 19 (miš)
Genomska lokacija za FXN
Genomska lokacija za FXN
Bend19|19 BPočetak24,238,817bp[2]
Kraj24,257,969bp[2]
ObrazacRNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcijaGO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
iron chaperone activity
2 iron, 2 sulfur cluster binding
oxidoreductase activity
ferrous iron binding
vezivanje iona metala
ferric iron binding
ferroxidase activity
Ćelijska komponentacitoplazma
citosol
mitochondrial matrix
mitohondrija
L-cysteine desulfurase complex
Biološki procesregulation of ferrochelatase activity
positive regulation of cell population proliferation
response to iron ion
iron-sulfur cluster assembly
ion transport
positive regulation of aconitate hydratase activity
positive regulation of cell growth
cellular response to hydrogen peroxide
negative regulation of release of cytochrome c from mitochondria
positive regulation of succinate dehydrogenase activity
protein autoprocessing
negative regulation of apoptotic process
small molecule metabolic process
iron ion homeostasis
iron incorporation into metallo-sulfur cluster
cellular iron ion homeostasis
heme biosynthetic process
positive regulation of lyase activity
GO:0048554 positive regulation of catalytic activity
Oksidacijska fosforilacija
mitochondrion organization
adult walking behavior
aerobic respiration
embryo development ending in birth or egg hatching
proprioception
negative regulation of multicellular organism growth
negative regulation of organ growth
Izvori:Amigo /QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

2395

14297

Ensembl

ENSG00000165060

ENSMUSG00000059363

UniProt

Q16595

O35943

RefSeq (mRNK)

NM_181425
NM_000144
NM_001161706

NM_008044

RefSeq (bjelančevina)

NP_000135
NP_852090

NP_032070

Lokacija (UCSC)Chr 9: 69.04 – 69.08 MbChr 19: 24.24 – 24.26 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Frataksin jeprotein koji je kodljudikodirangenomFXN.[5][6]

Nalazi se umitohondrijama, aiRNK frataksina se uglavnom eksprimira u tkivima s visokom brzinommetabolizma. Funkcija frataksina nije jasna, ali je uključen u sastavljanje klastera gvožđa i sumpora. Predloženo je da djeluje ili kao gvožđevšaperon ili kao protein za skladištenje gvožđa. Smanjena ekspresija frataksina je uzrokFriedreichove ataksije.

Aminokiselinska sekvenca

[uredi |uredi izvor]

Dužinapolipeptidnog lanca je 210aminokiselina, аmolekulska težina 23.135Da.[7]

1020304050
MWTLGRRAVAGLLASPSPAQAQTLTRVPRPAELAPLCGRRGLRTDIDATC
TPRRASSNQRGLNQIWNVKKQSVYLMNLRKSGTLGHPGSLDETTYERLAE
ETLDSLAEFFEDLADKPYTFEDYDVSFGSGVLTVKLGGDLGTYVINKQTP
NKQIWLSSPSSGPKRYDWTGKNWVYSHDGVSLHELLAAELTKALKTKLDL
SSLAYSGKDA

Struktura

[uredi |uredi izvor]

Rendgenska kristalografija pokazala je da se ljudski frataksin sastoji odβ-listova koje podržava par paralelnihα-heliksa, tvoreći kompaktni αβ sendvič.[8] Frataksinskihomolozi u drugih vrsta su slični, sa istom strukturom jezgra. Međutim, repne sekvence frataksina, koje se protežu od kraja jedne spirale, razlikuju se u sekvenci i razlikuju se po dužini. Ljudski frataksin ima dužu repnu sekvencu od frataksina koji se nalazi ubakterijama ilikvascima. Pretpostavlja se da je svrha repa stabilizacija proteina.[8]

Kao i većinamitohondrijskih proteina, frataksin se sintetizira ucitoplazmatskimribosomima, kao velike prekursorske molekule sa mitohondrijskim ciljanim sekvencama. Nakon ulaska umitohondrije, molekule seproteolitskom reakcijom razgrađuju kako bi se dobio zreli frataksin.[9]

Funkcija

[uredi |uredi izvor]

Frataksin je lokaliziran umitohondrijama. Funkcija frataksina nije potpuno jasna, ali izgleda da je uključen u sastavljanjegrupa gvožđe-sumporna grupa. Predloženo je da djeluje ili kao gvožđevšaperon ili kao protein za skladištenjegvožđa.[10]

FrataksinskaiRNK pretežno jeeksprimirana utkivima sa visokom stopommetabolizma, uključujućijetru,bubrege,smeđe masti isrce.Mišji ikvaščevi frataksinhomolozi sadrže potencijalnuN-terminalnu sekvencu ciljanja mitohondrija, a uočeno je da seljudski frataksin lokalizira s proteinommitohondrija. Nadalje, pokazalo se da poremećaj genakvasaca dovodi do disfunkcije mitohondrija. Stoga se vjeruje da jeFriedreichova ataksija mitohondrijskabolest uzrokovanamutacijom u jedarnom genomu (konkretno, ekspanzijaintronskog ponavljanjatripleta GAA u genu FXN, koji kodira protein frataksin).[5][11][12]

Klinički značaj

[uredi |uredi izvor]

Smanjena ekspresija frataksina je uzrokFriedreichove ataksije (FRDA),neurodegenerativne bolesti. Smanjenje ekspresije gena frataksina može se pripisati bilo utišavanjutranskripcije gena za frataksin zbogepigenetičkih modifikacija uhromosomskom entitetu[13] ili od nesposobnostiprerade produženog ponavljanja GAA u prvomintronu pre-iRNK kao ubakterijama[14] i ljudskim ćelijama[15] ili oboma. Ekspanzija introna ponavljajućeg trinukleotida GAA rezultira Friedreichovom ataksijom.[16] Ovo prošireno ponavljanje uzrokuje stvaranjeR-petlje, a upotrebaoligonukleotida usmjerena na ponavljanje da poremeti R-petlju može reaktivirati ekspresiju frataksina.[17]

Oko 96% pacijenata sa FRDA imaponavljajuću ekspanziju trinukleotida GAA uintronu 1 obaalela FXN gena.[18] Sve u svemu, to dovodi do smanjenja sinteze frataksinskeiRNK i smanjenja (ali ne i obustavlja) sintezu proteina frataksina kod ljudi sa FRDA. (Podgrupa pacijenata sa FRDA ima ekspanziju GAA u jednom hromosomu itačkastu mutaciju u FXNegzonu u drugom hromosomu.) U tipskom slučaju, dužinaalela sa kraćom ekspanzijom GAA obrnuto korelira sa nivoima frataksina . Periferno tkivo pacijenata sa FRDA obično ima manje od 10% nivoa frataksina koje pokazuju nepogođene osobe.[18] Niži nivoi frataksina rezultiraju ranijim početkom i bržim napredovanjem bolesti.

FRDA karakteriziraju ataksija, gubitak osjetila i kardiomiopatija. Nije sasvim jasan razlog zašto nedostatak frataksina uzrokuje ove simptome. Na ćelijskoj razini, povezan je s nakupljanjem gvožga u mitohondrijama i povećanom osjetljivošću na oksidanse. Iz razloga koji nisu dobro razumljivi, ovo prvenstveno utiče natkivokorijene dorzalnih ganglija,mali mozak isrčani mišić.[9]

Studije na životinjama

[uredi |uredi izvor]

Kod miševa je potpuna inaktivacija gena FXN smrtonosna u ranojembrioskoj fazi.[19] Iako gotovo svi organizmi eksprimirajuhomologe frataksina, ponavljanje GAA uintronu 1 postoji samo kod ljudi i drugihprimata, pa semutacija koja uzrokuje FDRA ne može prirodno pojaviti u drugim životinjama. Naučnici su razvili nekoliko opcija za modeliranje ove bolesti kod miševa. Jedan pristup je utišavanje ekspresije frataksina u samo jednom specifičnom tipu tkiva od interesa:srce (miševi modificirani na ovaj način nazivaju se MCK), svineuroni (NSE) ili samokičmena moždina imali mozak (PRP).[20] Drugi pristup uključujeinserciju ekspanzije GAA u prvi intron mišjeg gena FXN, koji bi trebao inhibirati proizvodnju frataksina, baš kao i kod ljudi. Miševi koji suhomozigotni za ovaj modificirani gen nazivaju se KIKI (skr. odeng.knock-inknock-in), a složeni heterozigoti nastali križanjem KIKI miševa s frataksinom – KIKO (skr.eng.knockoutinknock-out). Međutim, čak i miševi KIKO i dalje eksprimiraju 25-36% normalne razine frataksina i pokazuju vrlo blage simptome. Konačni pristup uključuje stvaranjetransgenih miševa sa GAA proširenom verzijom gena ljudskog frataksina. Ovi miševi se zovu YG22R (jedna GAA sekvenca od 190 ponavljanja) i YG22R (dvije GAA sekvence od 90 i 190 ponavljanja). Ovi miševi pokazuju simptome slične ljudskim pacijentima.[20]

Prekomjerna ekspresija frataksina uDrosophila pokazala je povećanje antioksidativnih sposobnosti, otpornost na povrede oksidativnog stresa idugovječnost,[21] podupirući teoriju da je uloga frataksina zaštititi mitohondrije od oksidativnog stresa i nastalog ćelijskog oštećenja.

Fibroblasti iz miševskog modela fibroblasta pacijenata sa FRDA i FRDA pokazuju povećane razine dvolančanih prekidaDNK.[22]Sistem isporuke gena za lentivirus je korišten za isporuku gena frataksina u FRDA model miša i ćelije ljudskih pacijenata, što je rezultiralo dugoročno obnovljenom ekspresijom frataksinskeiRNK i proteina frataksina. Ova obnovljena ekspresija gena frataksina bila je praćena značajnim smanjenjem broja prekida dvostruke DNK.[22] Čini se da oštećeni frataksin u ćelijama FRDA uzrokuje smanjeni kapacitet za popravak oštećeneDNK i to može doprinijetineurodegeneraciji.[22]

Interakcije

[uredi |uredi izvor]

Pokazano je da frataksin biološkistupa u interakciju s enzimomPMPCB.[23]

Reference

[uredi |uredi izvor]
  1. 123GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165060 -Ensembl, maj 2017
  2. 123GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059363 -Ensembl, maj 2017
  3. "Human PubMed Reference:".National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. "Mouse PubMed Reference:".National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. 12Campuzano V, Montermini L, Moltò MD, Pianese L, Cossée M, Cavalcanti F, Monros E, Rodius F, Duclos F, Monticelli A, Zara F, Cañizares J, Koutnikova H, Bidichandani SI, Gellera C, Brice A, Trouillas P, De Michele G, Filla A, De Frutos R, Palau F, Patel PI, Di Donato S, Mandel JL, Cocozza S, Koenig M, Pandolfo M (Mar 1996)."Friedreich's ataxia: autosomal recessive disease caused by an intronic GAA triplet repeat expansion".Science.271 (5254): 1423–7.Bibcode:1996Sci...271.1423C.doi:10.1126/science.271.5254.1423.PMID 8596916.S2CID 20303793.
  6. Carvajal JJ, Pook MA, dos Santos M, Doudney K, Hillermann R, Minogue S, Williamson R, Hsuan JJ, Chamberlain S (Oct 1996). "The Friedreich's ataxia gene encodes a novel phosphatidylinositol-4- phosphate 5-kinase".Nature Genetics.14 (2): 157–62.doi:10.1038/ng1096-157.PMID 8841185.S2CID 6324358.
  7. "UniProt, Q16595". Pristupljeno 8. 9. 2021.
  8. 12Dhe-Paganon S, Shigeta R, Chi YI, Ristow M, Shoelson SE (Oct 2000)."Crystal structure of human frataxin".The Journal of Biological Chemistry.275 (40): 30753–6.doi:10.1074/jbc.C000407200.PMID 10900192.
  9. 12Stemmler TL, Lesuisse E, Pain, Dancis (august 2010)."Frataxin and Mitochondrial FeS Cluster Biogenesis".Journal of Biological Chemistry.285 (35): 26737–26743.doi:10.1074/jbc.R110.118679.PMC 2930671.PMID 20522547.
  10. Adinolfi S, Iannuzzi C, Prischi F, Pastore C, Iametti S, Martin SR, Bonomi F, Pastore A (Apr 2009). "Bacterial frataxin CyaY is the gatekeeper of iron-sulfur cluster formation catalyzed by IscS".Nature Structural & Molecular Biology.16 (4): 390–6.doi:10.1038/nsmb.1579.PMID 19305405.S2CID 205522816.
  11. Dürr A, Cossee M, Agid Y, Campuzano V, Mignard C, Penet C, Mandel JL, Brice A, Koenig M (Oct 1996). "Clinical and genetic abnormalities in patients with Friedreich's ataxia".The New England Journal of Medicine.335 (16): 1169–75.doi:10.1056/NEJM199610173351601.PMID 8815938.
  12. Koutnikova H, Campuzano V, Foury F, Dollé P, Cazzalini O, Koenig M (Aug 1997). "Studies of human, mouse and yeast homologues indicate a mitochondrial function for frataxin".Nature Genetics.16 (4): 345–51.doi:10.1038/ng0897-345.PMID 9241270.S2CID 5883249.
  13. Kim E, Napierala M, Dent SY (Oct 2011)."Hyperexpansion of GAA repeats affects post-initiation steps of FXN transcription in Friedreich's ataxia".Nucleic Acids Research.39 (19): 8366–77.doi:10.1093/nar/gkr542.PMC 3201871.PMID 21745819.
  14. Pan X, Ding Y, Shi L (Nov 2009). "The roles of SbcCD and RNaseE in the transcription of GAA x TTC repeats in Escherichia coli".DNA Repair.8 (11): 1321–7.doi:10.1016/j.dnarep.2009.08.001.PMID 19733517.
  15. Baralle M, Pastor T, Bussani E, Pagani F (Jul 2008)."Influence of Friedreich ataxia GAA noncoding repeat expansions on pre-mRNA processing".American Journal of Human Genetics.83 (1): 77–88.doi:10.1016/j.ajhg.2008.06.018.PMC 2443835.PMID 18597733.
  16. "Entrez Gene: FXN frataxin".
  17. Li L, Matsui M, Corey DR (1. 1. 2016)."Activating frataxin expression by repeat-targeted nucleic acids".Nature Communications.7: 10606.Bibcode:2016NatCo...710606L.doi:10.1038/ncomms10606.PMC 4742999.PMID 26842135.
  18. 12Clark E, Johnson J, Dong YN, Mercado-Ayon, Warren N, Zhai M, McMillan E, Salovin A, Lin H, Lynch DR (novembar 2018)."Role of frataxin protein deficiency and metabolic dysfunction in Friedreich ataxia, an autosomal recessive mitochondrial disease".Neuronal Signaling.2 (4): NS20180060.doi:10.1042/NS20180060.PMC 7373238.PMID 32714592.
  19. Cossée M, Puccio H, Gansmuller A, Koutnikova H, Dierich A, LeMeur M, Fischbeck K, Dollé P, Kœnig M (maj 2000)."Inactivation of the Friedreich ataxia mouse gene leads to early embryonic lethality without iron accumulation".Human Molecular Genetics.9 (8): 1219–1226.doi:10.1093/hmg/9.8.1219.PMID 10767347.Arhivirano s originala, 2. 6. 2018. Pristupljeno 5. 4. 2019.
  20. 12Perdomini M, Hick A, Puccio H (17. 7. 2013)."Animal and cellular models of Friedreich ataxia".Journal of Neurochemistry.126: 65–79.doi:10.1111/jnc.12219.PMID 23859342.S2CID 1427817.
  21. Runko AP, Griswold AJ, Min KT (mart 2008)."Overexpression of frataxin in the mitochondria increases resistance to oxidative stress and extends lifespan in Drosophila".FEBS Letters.582 (5): 715–9.doi:10.1016/j.febslet.2008.01.046.PMID 18258192.S2CID 207603250.
  22. 123Khonsari H, Schneider M, Al-Mahdawi S, Chianea YG, Themis M, Parris C, Pook MA, Themis M (decembar 2016)."Lentivirus-meditated frataxin gene delivery reverses genome instability in Friedreich ataxia patient and mouse model fibroblasts".Gene Ther.23 (12): 846–856.doi:10.1038/gt.2016.61.PMC 5143368.PMID 27518705.
  23. Koutnikova H, Campuzano V, Koenig M (Sep 1998)."Maturation of wild-type and mutated frataxin by the mitochondrial processing peptidase".Human Molecular Genetics.7 (9): 1485–9.doi:10.1093/hmg/7.9.1485.PMID 9700204.

Dopunska literatura

[uredi |uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi |uredi izvor]
PDB galerija
Vanjska membrana
Razgradnja masnih kiselina
tryptophan metabolizam
monoamine neurotransmitter
metabolism
Intermembrane space
Inner membrane
oxidative phosphorylation
pyrimidine metabolism
mitochondrial shuttle
steroidogenesis
other
Matrix
ciklus limunske kiseline
anaplerotic reactions
urea cycle
alcohol metabolism
Other/to be sorted
Mitochondrial DNA
Complex I
Complex III
Complex IV
ATP synthase
tRNA
Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=FXN&oldid=3771214"
Kategorije:

[8]ページ先頭

©2009-2025 Movatter.jp