Proreini DEAD-kutija uključeni su u niz metaboličkih procesa koji obično uključujuRNK, ali u nekim slučajevima i drugenukleinske kiseline.[2] Vrlo su konzervirani u devet motivnih sekvenci i mogu se naći u većiniprokariota ieukariota, ali ne u svim. Mnogiorganizmi, uključujući ljude, sadržehelikaze DEAD-kutije (SF2) koje su uključene umetabolizam RNK.[3]
Proteini iz ove kutije prvi put su skrenuli pažnju kasnih 1980-ih u studiji koja je proučavala grupu NTP-mjesto vezanja koja je po sekvenci slična eIF4A RNK-helikaznoj sekvenci.[4] Rezultati ove studije pokazali su da ovi proteini (p68, SrmB, MSS116, vasa, PL10, eIF4Asisara, eIF4Akvasaca) uključeni umetabolizam RNK imaju nekoliko zajedničkih elemenata.[5] Utvrđeno je da je među proučavanimvrstama konzervirano devet uobičajenih sekvenci, što je važan kriterij porodice DEAD-kutija.[5] Devet konzerviranih motiva su: Q-motiv, motiv 1, motiv 1a, motiv 1b, motiv II, motiv III, motiv IV, motiv V i motiv VI, kako je prikazano na slici. Motiv II je također poznat i kaoWalkerov B-motiv i sadrži aminokiselinsku sekvencu D-E-A-D (asp-glu-ala-asp), koja je ovoj porodici proteina dala ime“DEAD-kutije”.[5] Motiv 1, motiv II, Q motiv i motiv VI potrebni su za vezivanje ihidrolizuATP-a, dok motivi, 1a, 1b, III, IV i V mogu biti uključeni u intramolekulska preuređenja i interakciju RNK.[6]
Porodice DEATH i [[[SKI-protein|SKI]]) su imale proteine za koje je identificirano da su povezani sa porodicom DEAD-kutija.[7][8][9] These two relatives have a few particularly unique motifs that are conserved within their own family. Porodice DEAD-kutija, DEAH i SKI nazivaju se DExD/H proteini.[10] Svi se međusobno prilično razlikuju i ne postoji jedan protein koji pripada više od jedne od ovih porodica. Smatra se da svaka porodica ima posebnu ulogu u metabolizmu RNK, naprimjer proteini DEAD- i DEAH-kutija stimuliraju aktivnostiNTPaza, ali proteini DEAD-kutija koristeATP, a ne DEAH.[6]
Različite promotorske sekvence i pomoćni domeni koje pomažu u odmotavanjuRNK. Crvene regije su domeni za vezanjeATP-a, a žute regije su domeni interakcijeRNK. Prisutne su i određene sekvence nazvane DEAD-kutijski proteini koje pomažu u kataliziranju reakcija u kojima ATP ne mora biti direktno hidroliziran, sve dok se veže za domene na lancu.
^Tanaka N, Schwer B (July 2005). "Characterization of the NTPase, RNA-binding, and RNA helicase activities of the DEAH-box splicing factor Prp22".Biochemistry.44 (28): 9795–803.doi:10.1021/bi050407m.PMID16008364.
^abde la Cruz J, Kressler D, Linder P (May 1999). "Unwinding RNA in Saccharomyces cerevisiae: DEAD-box proteins and related families".Trends Biochem. Sci.24 (5): 192–8.doi:10.1016/S0968-0004(99)01376-6.PMID10322435.
