C16orf58
Identifikatori
Aliasi	RUSF1
Vanjski ID-jevi	MGI:2384572HomoloGene:11232GeneCards:RUSF1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 16 (čovjek)[1] Bend 16p11.2 Početak 31,489,471bp[1] Kraj 31,509,309bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 7 (miš)[2] Bend 7|7 F3 Početak 127,870,551bp[2] Kraj 127,897,342bp[2]
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	64755	233913
Ensembl	ENSG00000140688	ENSMUSG00000030780
UniProt	Q96GQ5	Q91W34
RefSeq (mRNK)	NM_022744	NM_145590 NM_001360882
RefSeq (bjelančevina)	NP_073581	NP_663565 NP_001347811
Lokacija (UCSC)	Chr 16: 31.49 – 31.51 Mb	Chr 7: 127.87 – 127.9 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Otvoreni okvir čitanja 58 hromosoma 16 iliC16orf58, znan i kaoFLJ13638, jestprotein koji je kodljudikodirangenomC16orf58.^[5] Sam gen dug je 18892 bp, saiRNK od 2760 bp i proteinskom sekvencom od 468aminokiselina. Postoji konzervirani domen nepoznatog sastava, DUF647. Za ovaj gen još nije utvrđena funkcija, ali se predviđa je uendoplazmatskom retikulumu ucitoplazmi.^[6]

Struktura

Dužinapolipeptidnog lanca je 468aminokiselina, amolekulska težina 51.018Da^[7].

Simboli

Iako je dugo bilo poznato da postoji nekoliko lokacija koja će dati predviđanja o strukturi proteina, C16orf58 , tek nedavno određen je njegov gornji aminokiselinski sastav strukturu. Zaključeno je da ima bar jedantransmembranski domen, ako ne i više. Unutar strukture proteina postoji nekoliko proširenih područja s nenabijenim aminokiselinama, što bi mogli biti mogući transmembranski domeni ilihidrofobna jezgra.^[6] Sljedeće prikazuje naboj svake od aminokiselina u sekvenci proteina, + za pozitivne, – za negativne i 0 za nenapunjene. Veliki segmenti nenabijenih aminokiselina su podebljani. Ovi dijelovi nenabijenih aminokiselina konzervirani su u prošlosti u udaljeniortolozima.

      1  00—000-00 000-00000- 0+00+000-0 0000-0000+ 00000+0000 +0-0+-00-0      610000000000 0000000000 000-0000-0 000000-000 0000000000 0000000000     1210000+00000 0000000+-0 00000+0000 00+00+0-00 0+00+000-0 00-00000-0     1810000000000 000000000+ 0000000000 +00000000+ +0000-000+ -000-00000     2410000000000 0000000000 0000000000 000000+00+ 0000-000-0 +0+000+000     301  0+0-00-000 00+0-00000 0000000000 0000+00000 0-00000-00 0-000000-0     361  0000000000 0+000+000+ 0000000000 000-00000- 0—0+0+0+0 00++-00000     421  +-00-00-00 00+00+000- 000+0-+000 -00-0+0000 000-++00

C16orf58 ima vrlo zanimljivu konzerviranost jer se dalekiortolozi nalaze ubiljkama igljivama. Međutim, nidu pronađeni kodgmizavaca,ptica ilivodozemaca. Sljedeća tabela prikazuje neke, ali ne sve, ortologe koji su pronađeni pomoćuBLAST-a.^[8]

Iako je funkcija još uvijek nepoznata, dokazano je daC16orf58 komunicira s tri različita proteina:

• MVD^[9] MVD je skraćenica oddisfosfomevalonat dekarboksilaza,enzim koji funkcionira u biosinteziholesterola.^[10]
• BSCL2^[11]BSCL2 je urođena Bernardinelli-Seipova lipodistrofija 2, ili seipin.^[12] Nalazi se uendoplazmatskom retikulumu i smatra se važnim u morfologijilipidnih kapljica.
• TSC22D4^[11] Treći protein u interakciji je TSC22D4, član porodice domena TSC22 4 i funkcionira kao translacijski regulatorleucinskog zatvarača.^[13]

• Lokacija ljudskog genomaC16orf58 i stranica sa detaljima o genuC16orf58 uUCSC Genome Browseru.

• Geni na hromosomu 16
• Ljudski proteini
• Proteomika

• CS1 održavanje: nepreporučeni parametar