休斯决定调查第五实验室,大总统发现一行人要行动,表示自己也要跟去,为了救爱德华二人。斯卡被打到地下一奇怪花纹区域,格拉托尼讨厌这里,不追了。拉斯特抓了阿尔。塔克说这些半成品红水都是马尔科留下的,没法变回人了,不如把它继续加工成贤者之石,更有意义。爱德华准备操作,红水有上下两层,爱德华要同时使用这两层的原料,恩维偷偷带了一群犯人来下层,爱德华并未发现。爱德华说自己制成贤者之石后就带阿尔远走高飞,剩下的随便你们。金布里也在那群犯人中,在红水加持下,他用炼金术直接把身边的犯人变成炸弹炸了,爱德华惊讶发现楼下还有这么多人,恩维也现身把爱德华击倒,说是那个人让你活着你才能活到现在的,绝不能饶了你,你继承了那人的血脉。随后拉斯特也来了,塔克说拉斯特几人是完美的人造人,他们会告诉自己秘诀,这样自己就能通过脑中的记忆制造出自己理想中完美的妮娜了,拉斯特说自己的目的是用贤者之石成为人,恩维说我们不是被造出来的,是生出来的。拉斯特说我们不会炼金术,只能散播相关线索,引导对贤者之石有兴趣的人去完成它。爱德华意识到自己经历的各种事件都是拉斯特几人暗中操控的,他不愿承认自己和阿尔是被引导过来的,坚称是为了自己才走到这一步的,不是被人操纵的。拉斯特说我们教你如何制造贤者之石,等价交换希望你把我们变成人,拉斯特杀了48号,接着又把阿尔做人质,要求爱德华开始合成贤者之石,爱德华被迫接受指令准备操作,阿尔让他住手,说这些犯人都是活人啊,我不想牺牲别人换回自己的身体。恩维说只要活着多少都是在夺取别人的生命,拉斯特说要完成什么事就一定伴随着牺牲,你们不是决心进入成人社会吗,现在又要找借口回去做小孩吗。最终爱德华还是下不了手,这时斯卡赶来破坏了设施,让爱德华带阿尔快逃,哥哥就是要保护弟弟的,爱德华则因为接触大量红水,能力暴走不受控制。这时大总统也下令突击实验室,救爱德华二人,抓军人,其他人杀了。金布里与另外三人相遇。罗斯发现发狂的爱德华抱了上去,爱德华想到了母亲,平静下来。拉斯特三人变装成军人逃离,总统秘书对三人说辛苦了,阿姆斯特朗带爱德华兄弟走出。