先月亡くなったノンフィクション作家・利根英二郎の息子・貴洋氏と航介氏に招待された小五郎は蘭、コナンを連れて、この南海の小島へとやってきた。
しかし、そこには利根英二郎の残した遺産をめぐる複雑な人間模様が渦巻いていた。

そんな折、何者かにより外部へと続く唯一の道である橋が爆破されてしまう。
完全に孤立化した小五郎たち。そして次々と巻き起こる様々な事件と問題。

この完全な孤島で、真相は解明されるのか…