1993年12月17日にメガドライブ用ソフトとして発売された。また、ファンタシースターシリーズの4作目にして同シリーズの完結編としても位置づけられている。そのため、過去作へのオマージュやファンサービスが多数用意されている。
当初のタイトルは『ファンタシースターIV』だったが、最終的に「IV」は取り払われた（しかし海外版では「IV」が付いている）。
2004年にはメディアカイトよりWindows版が発売された。また、初期4作をまとめた1998年4月2日発売の『SEGA AGES/ファンタシースターコレクション』（セガサターン）および、2008年3月27日発売の『セガエイジス2500シリーズ ファンタシースター コンプリートコレクション』(プレイステーション2)に収録されている。2008年6月24日からはWiiのバーチャルコンソールでメガドライブ版が配信開始（要700Wiiポイント）。
イベント発生時では、小さなウインドウを次々と表示し、漫画のコマのように見せる演出が特徴的である。