荒廃した世界を舞台に、元気な少女が戦い抜く！
環境の劇的変化と未知の汚染物質によって人口が激減、国家が崩壊した世界で、少女、マコトは、廃墟となった新宿をテリトリーとする「第三機動衛士隊」の一員として生きていた……。