主人公の高校生宇津木涼は、悪魔王ダンテのいけにえにされるが、逆にダンテの心を乗っ取ってしまう。悪魔となったことを悩む涼であったが、実は悪魔と呼ばれる人種が、地球の先住人種であり、侵略者である「神」のむごいしうちによって異形化した存在であることを知る。さらに自分自身、神の目を欺くために人間の遺伝子の中に潜入した本物のダンテであることを知り、悪魔軍団の指導者として、神の子孫である人間と戦うことを決意する。物語はダンテが悪魔軍団を集結させ、いよいよ人間に戦いを挑むところで終結する。