3个常在秋叶原一带活动的御宅族，由于是某一个聊天室网站的常客，因而结识。透过该聊天室站长的牵线，又另外有3人加入。这六人各有所专长，但也都各有缺陷。
　　六人决定合组一家IT公司，称为“秋叶原@DEEP”。起初以制作偶像网站获得收入，后来一同合力开发一套具有人工智能能力的搜寻引擎。这套搜寻引擎经由一名驻日美军的BLOG所披露介绍后，声名大噪，使用者增多。但是也引起某家大型IT公司注意，该公司起先出了高价欲收购其搜寻引擎，但遭拒绝后开始用各种手段要夺取该搜寻引擎以纳入自己的网站。双方因此展开了一场争斗。