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位于横滨仓库街的福尔摩斯侦探事务所，面临着倒闭的危机。现在只剩下见习侦探野田凉介和他的助手出水京子了。此时老板请来了著名的美食侦探高野圣也，一心振兴福尔摩斯事务所的凉介，则被老板下令成为圣也的助手，但圣也是个令人难以置信的大胃王，且太过神秘让凉介和京子都对他充满了不信任感。
　　最终经过一系列的合作，圣也带着凉介破获了不少奇案。之后打扮酷似动画里名侦探江户川柯南的男孩金田一，也加入到他们的行列，于是美食侦探率领“福尔摩斯侦探事务所”的“侦探”们，再一次为帮警方分忧解难破解各种案件。