克蕾尔他们正式成为阿蕾西娅精灵学院代表，朝着举办地——圣域 拉格纳·伊斯？ Ragna·Ys进发。
　　穿着泳装修禊的克蕾尔小队成员间的增强了团结度，但是突然、操纵着军用精灵的谜之刺客袭来。
　　那个袭击者的正体，是<教导院>时代把神人称作哥哥而爱慕着的少女，ミュア（myua）。
　　在因为迫近的过去而动摇的神人面前，暗精灵蕾斯蒂亚以及最强剑舞姬莲·阿修贝尔的身姿显现……
　　没有变化的东西。变化了的东西。被舍弃的过去与现在的瞬间相交——元素·幻想第四弹！