和传统RTS作品一样，《乙金战争》也分为三个派系，每一个都有自己独特的角色AI，优劣势，技术和特殊技能，例如天气控制，间谍渗入和预知未来的能力。
玩家要经营自己的资源，向外建立哨站来扩张自己的版图，使用包括步兵、坦克、飞行器、和巨型战争巨像等多兵种单位构建的强大军团将敌人击溃。
《乙金战争》拥有一个独立的动态天气系统，该系统将对玩家的战略有着直接的影响。玩家可以利用沙尘暴来“隐身”靠近敌人基地，或者是通过冰冻河流来发起一次毁灭性的打击。
《乙金战争》共有7个星球，每个都有多样的环境和多样的地形，强迫玩家改变不同的战略。
游戏中的“征服”模式是非线性，也就是说，玩家可以自由决定他们的征服过程。
玩家也可以使用科技研究来开发一个技术树，来解锁新的武器和升级，获得新的建筑来发展自己的殖民地和使用新的特别技能。