Създаването на футболен клуб „Болоня“ се осъществява по идея на австриеца Емилио Арнстайн и неговия брат. Двамата се запалват по футбола в университета и преди да дойдат в Италия, за да създадат „Болоня“, братята създават „Блек Стар“ ФК вАвстрия.
На 3 октомври 1909 г. в едноименния град е създаден ФК „Болоня“. На учредителното събрание е определено цялостното ръководство на клуба, а цветовете на отбора – червено и синьо са заети от английския „Кристъл Палас“.
На 20 март 1910 г. отборът на Болоня играе първия си официален мач срещу облечените в бяло играчи на „Виртус“. Първия сезон „фелсинейте“ прекарват в регионалната дивизия, която печелят, за да си осигурят промоция в дивизията, наречена Група „Венето-Емилиано“. „Рособлу“ играят там четири сезона и преди футболните състезания да бъдат прекъснати отПървата световна война, болонци се изкачват в северната лига на Италия.
След войната формата на „Болоня“ се подобрява и те жънат успех след успех. Стъпка по стъпка отборът достига до успеха. През сезон 1924/25 „Болоня“ печели северната лига, а след това и държавния шампионат. Във финалния мач през 1925 г. надиграва столичаните от „Рома“ с категоричното 6:0. „Болоня“ повтаря успеха си през сезон 1928/29. Това е и последният сезон преди преустройството на италианския футбол и създаването на Серия А. „Рособлу“ се утвърждава като водещ отбор на апенините и предиВтората световна война печели скудетото още четири пъти.
Световната война приключва и футболът в Италия е възроден. Шампионите от „Болоня“ не показват формата от преди години и през петото и шестото десетилетие на миналия век се задържат около петото място в класирането. През 1964 г. обаче „Болоня“ си връща славата, като отново става шампион на Италия. През 70-те години тимът губи блясъка си, но успява на два пъти да спечели купата на страната и да запази вярата на феновете.
През сезон 1981/82 започва тежък период в историята на клуба. Първо „Болоня“ губи битката с „Дженоа“ и „Каляри“ за оставане в Серия А и изпада от италианския елит. Следващите два сезона не са по-успешни и клубът отпада на два пъти, за да се озове в Серия Ц1. През 1996 г. футболистите се радват на кратък ренесанс и се завръщат в Серия А. През 1998 г. болонци дори печелят европейска слава. Клубът печели турнира Купа „Интертото“ и участва в надпреварата заКупата на УЕФА. Отборът остава в най-горната дивизия до сезон 2004/05, когато губи плейофите от „Парма“ и отново изпада.
През следващия сезон феновете очакват от тима борба за завръщане в елита, но турбуленция вътре в клуба води до лошо представяне на отбора в червено и синьо. Два сезона тимът е заклещен по средата на таблицата, но в кампанията през 2007/08 под ръководството на Даниеле Аригони „Болоня“ е втори вСерия Б и печели автоматична промоция и завръщане сред най-добрите.