宇宙飛行士を目指す5人の少年少女が成長する姿を、彼らの友情や宇宙への想い、過去との葛藤を中心に描いたSFファンタジー作品である。
「ふたつのスピカ」の連載はメディアファクトリー発行の「月刊コミックフラッパー」で2001年10月号に開始され、2009年9月号を持って完結した。コミックスは全16巻。
柳沼行は連載開始前、同誌2000年7月号から、「2015年の打ち上げ花火」を始めとする5本の読み切り短編（アスミシリーズ）を発表している。主人公が中学校を卒業するあたりから始まる本編に対し、読み切り短編は小 - 中学校時代を描いている。これらの作品は厳密に言うと「ふたつのスピカ」ではないが、短編の設定を引き継いで本編が描かれているため、現在では「ふたつのスピカ」の一部分として扱われている。この短編作品はコミックスの1巻から3巻に収録されている。
上記の他に書き下ろし短編の「350番テーブルのスピカ」があり、「アニメ設定資料集」に収録されている。