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Deleted articles cannot be recovered. Draft of this article would be also deleted. Are you sure you want to delete this article? Information 2024/1/8: pandas , Polars など18を超えるライブラリを統一記法で扱える統合データ処理ライブラリ Ibis の100 本ノックを作成しました。長期目線でとてもメリットのあるライブラリです。こちらも興味があればご覧下さい。 Ibis 100 本ノック https://qiita.com/kunishou/items/e0244aa2194af8a1fee9 はじめに どうもこんにちは、kunishouです。 この度、PythonライブラリであるPolarsを効率的に学ぶためのコンテンツとして
Deleted articles cannot be recovered. Draft of this article would be also deleted. Are you sure you want to delete this article? なぜこの記事を書くのか 皆さん、データ解析を行う際にどのようなライブラリを用いているでしょうか。 おそらく大半の人はpandasを使っているのではないでしょうか。 私もpandas使ってます。簡単だよね(´・ω・`) しかし、業務でバカクソでけえデータを読み込もうとしたときに、読み込み時間がとんでもなくかかったり、メモリ不足でそもそも読み込めもしないことが起きていました。 読み込みにメモリ食われすぎて他の作業ができずに待機した挙句、燃え尽きたかのようにノーパソのファンが止まると同時にメモリ不足のエラーが出たときには切れ散らかします。 (
門脇@satoru_kadowakiです。今月のPython Monthly Topicsでは、Rust製の高速データフレームライブラリ Polars について紹介します。 Polarsとは Pythonでデータ分析に使用される主なライブラリに pandas があります。Polarsはpandasと同様にデータフレームというデータ構造オブジェクトを提供するサードパーティライブラリです。特にpandasを意識して作られており、メインページに「Lightning-fast DataFrame library for Rust and Python」とあるように、Rustによる高速処理を謳っています。 Polarsのリポジトリや関連ドキュメントは以下を参照してください。 Github: https://github.com/pola-rs/polars ユーザーガイド: https://pola
PolarsというPandasを100倍くらい高性能にしたライブラリがとても良いので布教します1。PolarsはRustベースのDataFrameライブラリですが、本記事ではPythonでのそれについて語ります。 ちなみにpolarsは白熊の意です。そりゃあまあ、白熊と大熊猫比べたら白熊のほうが速いし強いよねってことです2。 何がいいの? 推しポイントは3つあります 高速! お手軽! 書きやすい! 1. 高速 画像はTPCHのBenchmark(紫がPolars)3。 日本語でも色々記事があるので割愛しますが、RustやApach Arrowなどにお世話になっており、非常に速いです。MemoryErrorに悩まされる問題も解決されます。開発者のRitchieがしゃれおつなツイートをしてるので、そちらも参考にどうぞ ↓ 4。 抄訳: (ひとつ目)Pandasは黄色くした部分でDataFram
Polars is an open-source library for data manipulation, known for being one of the fastest data processing solutions on a single machine. It features a well-structured, typed API that is both expressive and easy to use. Polars Cloud is currently available to a group of select organizations. This platform manages the compute infrastructure, allowing you to focus solely on writing queries while seam
Pythonから利用できるRust製超高速データ分析ライブラリPolarsの実力:Rustで始めるWebアプリケーション(終) RustでWebアプリケーションを開発する際に基礎となる要素技術からRustの応用まで、Rustに関するあれこれを解説する本連載。第3回は、Rust製の高速データ分析ライブラリであるPolarsの速度を簡易的に検証し、考察する。 paizaでWebエンジニアをやっています藤田と申します。前回の連載では、RustでWebアプリの基礎となるセッション管理と、SNSのAPIサーバを構築するための実装概略、Rustの強力な型システムによるサーバサイドアプリケーションの記述性について示しました。 今回は、趣向を変えてRust製の高速データ分析ライブラリである「Polars」を利用し、その速度を簡易的に検証、考察します。今回のプロジェクトもGitHubのサンプルリポジトリを用
記事の趣旨 本記事では、Rust製の高速データフレームであるPolarsのRuby版を利用して、データサイエンティスト協会の提供する「データサイエンス100本ノック(構造化データ加工編)」をやってみることを目的にしています。 Polarsについては、下記の公式サイトを参照してください。 Ruby版のPolarsは、polars-dfというgem名で開発されています。 Rubyを使用したデータサイエンスライブラリをばりばり開発されているankane(Andrew Kane)さんによるgemです。 深層学習やデータフレーム、LightGBM、ベイズ推定など幅広い用途のRuby用データサイエンスライブラリを開発されているすごい方です。 また、本記事では「データサイエンティスト協会スキル定義委員」の「データサイエンス100本ノック(構造化データ加工編)」を利用しています。 実際のデータサイエンスの
これらのメソッドを使用することで、データフレームの列に対して.when()で定義した条件に従ってデータの操作を行えます。たとえば以下のサンプルスクリプトでは、楽器名と演奏者数のデータフレームに対して条件により「Group」列を追加しています。 example03.py:.when()で指定された条件で新たな列を追加するサンプル import polars as pl # サンプルデータフレームを楽器名と演奏者数で作成 df = pl.DataFrame( { "Instruments": ["Violin", "Trombone", "Flute", "Cello", "Trumpet"], "Players": [5, 1, 3, 2, 1], } ) # 新しい列 'Group' を条件に基づいて作成 df = df.with_columns( pl.when(pl.col("Play
rustでデータ分析100本ノックをやってみたら、めっちゃ書きやすかった話【Polars】 まとめ rustのPolarsは、思ったよりもずっと直感的な書き味でイイ👍 pandasよりも早い(ブレイジングファスト!)のでイイ👍 ワケあってpython(pandas)が使えない環境でも使えてイイ👍 対象読者 rust初心者~中級者 とりあえずrustでデータ分析をしてみたい方 python(pandas)を使わずにデータ分析をしてみたい方 対象でない読者 rustに慣れていて、たくさんのexampleは必要ない方 パフォーマンスを最高にするために、Polarsを学びたい方 Polarsとは python でデータ分析を行う場合、pandas を使うのが一般的です。 rust でpandasに相当するライブラリがPolarsです。 ドキュメントが充実しており、多彩な機能を持っているほか、
shape: (891, 12) ┌─────────────┬──────────┬────────┬──────────────────┬───┬────────────┬─────────┬───────┬──────────┐ │ PassengerId ┆ Survived ┆ Pclass ┆ Name ┆ … ┆ Ticket ┆ Fare ┆ Cabin ┆ Embarked │ │ --- ┆ --- ┆ --- ┆ --- ┆ ┆ --- ┆ --- ┆ --- ┆ --- │ │ i64 ┆ i64 ┆ i64 ┆ str ┆ ┆ str ┆ f64 ┆ str ┆ str │ ╞═════════════╪══════════╪════════╪══════════════════╪═══╪════════════╪═════════╪═══════╪═══════
pandasではデフォルトでは文字列をオブジェクトデータ型で扱うようになっています。それに対してpolarsには最初から文字列専用のデータ型が用意されています。 pandasで日付を扱う場合は一般的には時刻を0:00:00にした日時np.datetime64で代用しますが、polarsには日付のみを扱うpl.Dateが存在し、また時刻のみを扱うpl.Time、日付+時刻を扱うpl.Datetimeもそれぞれ存在します。 型変換メソッド、つまりpandasの.astype()は、polarsでは.cast()です。 エクスプレッション(pl.Expr()) polarsには、データフレーム・シリーズとは別にエクスプレッションというクラスが存在します。エクスプレッションは「一連の操作の命令」だと思うとよいでしょう。 例えば、「"A"列を選択→3で割る→10より小さい値は2倍して大きい値は2で割
import os import polars as pl dtypes = { 'customer_id': str, 'gender_cd': str, 'postal_cd': str, 'application_store_cd': str, 'status_cd': str, 'category_major_cd': str, 'category_medium_cd': str, 'category_small_cd': str, 'product_cd': str, 'store_cd': str, 'prefecture_cd': str, 'tel_no': str, 'postal_cd': str, 'street': str, 'application_date': str, 'birth_day': pl.Date } df_customer = pl.read_c
はじめに ここ最近、Polarsについて調べる中で色々と面白そうだと思い現在勉強中です。今回の記事では勉強内容の整理も兼ねて、Polarsの特色を紹介できればと思っています。 Polarsとは RustとPythonで使える[1]超高速("Blazingly fast")DataFrameライブラリー、つまりデータ解析に使えるライブラリーとなります。pandasに対するPolars(しろくま)であり洒落ているなと思います。 Core部分はRustで実装されており、インターフェースとしてPythonからも呼び出せるようになっています。RustからPythonパッケージへのビルドはmaturin(PyO3)を使っています。 環境 記事作成時のOSや言語、ライブラリーのバージョンは以下になります。関連が強そうなもののみ抜粋しています。 Ubntu 22.04 Python 3.10.6 (mai
Polarsは表形式のデータ構造であるDataFrameの処理を行うためのライブラリで、その高速性と優れたAPI設計から、現在広く用いられているpandasの後継として注目を集めています。高速性の源は、遅延実行を導入することで最適化を可能にしたこと、バックエンドにRustを用いることでマルチコアやSIMD命令を可能にしたことにあります。APIも「エクスプレッション」という概念を導入することで、シンプルかつ高機能にまとまっており、理解しやすく使いやすいものになっています。本書はPolars開発者Ritchie Vink氏の所属するXomnia社の開発者二人により執筆され、Polarsの基本的な使い方からより高度な最適化、並列化の方法をカバーしています。さらには内部構造やRustプラグインによる拡張方法にまで踏み込んでおり、Polars解説書の決定版と言える内容です。 序 はじめに 第Ⅰ部 始
環境 CPU : Ryzen 7 3700X GPU : RTX3090 OS : Windows11 / WLS2(Ubuntu 20.04) (GPUとCPUのスペック差ありすぎだろというのは承知してますが、許してください。) ライブラリ pandas : 1.3.5 polars : 0.15.16 cudf : 21.10.01 定義 カテゴリ_カラム数:groupbyやmergeで使うkeyの数(※行数が増えるとカテゴリの数は増えます。) 集計先_カラム数:上記のカラム以外のカラムの数。groupbyなどで平均値などが算出されるカラム 比較 groupby 行数の変化 コード例 df.groupby(['Category']).mean() カテゴリ_カラム数:1固定 集計先_カラム数:1固定 行数 pandas polars cudf 10000 0.002895 0.0031
I recently tried to light the tinder for what I hoped would be a revolt — the Single Node Rebellion — but, of course, it sputtered out immediately. Truth be told, it was one of the most popular articles I’ve written about in some time, purely based on the stats. The fact that I even sold t-shirts, tells me I have born a few acolytes into this troubled Lake House world. Without rehashing the entire
この記事は毎週必ず記事がでるテックブログ Loglass Tech Blog Sprint の62週目の記事です! 2年間連続達成まで残り44週となりました! ログラスの龍島(@hryushm)です。寒くなってきましたね。最近は鴨肉を焼くのがマイブームです。ということで今日はPolarsとDuckDBの話です。 PolarsとDuckDBは、近年注目を集めているデータ処理のための高速なクエリエンジンです。それぞれ異なる強みを持っていますが、どちらもシングルノードでOLAPの分析処理を非常に高速に実行できるという共通点があります。この記事では、データソースにPostgreSQLを用いた場合において、PolarsとDuckDBのパフォーマンスにどのような違いが現れるのかについて比較します。 Polarsとは Polarsは、Rustで実装されたデータフレームライブラリで、特にパフォーマンスに優
追記 2023/07/15 polars 0.18.7 では修正されているとのコメントを頂きました。この記事はpolars 0.16.7 時点に執筆したものであることに注意してください。 今流行りのpolarsを触ってみたらある条件を満たすと劇遅になった件について書きます。しかも一度遅くなるとセッションを再起動するまでずっと遅いです。なかなか気が付きにくいので記事にしておきます。 環境 幣計算環境は以下の通りです。他の条件で同じ現象が起こるかは未確認です。コードは置いておくので、polarsの利用を考えている方は事前に同様の問題が起きないか確かめておいた方が良いかもしれません。 OS: Windows 11 Pro (Version 22H2, OS build 22621.1265) CPU: AMD Ryzen 7 5800X 8-Core Processor 3.80 GB RAM:
import polars as pl pl.show_versions() ---Version info--- Polars: 0.16.6 Index type: UInt32 Platform: Linux-5.15.79.1-microsoft-standard-WSL2-x86_64-with-glibc2.31 Python: 3.10.9 (main, Dec 27 2022, 12:45:52) [Clang 15.0.6 ] ---Optional dependencies--- pyarrow: 10.0.1 pandas: 1.5.3 numpy: 1.24.2 fsspec: <not installed> connectorx: <not installed> xlsx2csv: <not installed> deltalake: <not installed
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最近は Polars が気に入っていて、主にプライベートで使っている。 ただ、エコシステムという観点では Pandas に比べて発展途上の段階にあると思う。 そこで、今回は発展の一助として「Shirokumas」というライブラリを作ってみた。 github.com どんなライブラリかというと、現時点の機能では Pandas の category_encoders 1 のサブセットに相当する。 より具体的には、scikit-learn のスタイルで書かれた特徴量抽出をするための基本的なエンコーダを実装してある。 特徴としては、同じ処理を完了するまでにかかる時間が短いこと。 Pandas のエコシステムで使われるフレームワークとパフォーマンスを比較したグラフを以下に示す。 グラフから、比較対象の概ね 1/10 以下の時間で処理を完了できることが分かる。 詳細については、このエントリの後半に記述
この記事は何? データバリデーションライブラリのPanderaがPolarsのサポートを開始したので、早速それを試してみるもの。基本的なバリデーションのやり方を確認した上で、実行速度への影響を簡単な実験で確認した。 なお2024/3/16現時点では本機能はベータ版という状態であるため、今後なんらかの大きな変更が発生する可能性がある。最新の情報を得たい場合は、公式のリリースやドキュメントを参照してほしい。 Beta release 0.19.0b0: Polars integration Data Validation with Polars 前提 Panderaとは? Panderaは、pandas.DataFrameのような2次元の表形式の構造を持つデータ(=データフレーム)に対するバリデーションを提供するライブラリである。事前にデータフレームに対して、各カラムの型や制約をスキーマとして
この記事は Magic Moment Advent Calendar 2023 10 日目の記事です。 Magic Moment Data チームというチームでプロダクトのデータを活用した機能の検討・開発をしている @nagomiso と言います。好きな物はお酒とラーメンで普段は 9% チューハイ[1] で喉の渇きを癒しています。 さて Python でデータ加工や集計処理をするときに欠かせないライブラリと言えば pandas ですね。なんだかんだ Tabular Data を扱う時には欠かせないライブラリだと思います。 そんな定番ライブラリを高速化するライブラリとして颯爽と現れたのが FireDucks です。 2023-10-19 のファーストリリース以来ずっと気になっていたライブラリだったのでこの機会に触ってみようというのがこの記事の趣旨です。 FireDucks FireDucks
こんちには。 データアナリティクス事業本部 機械学習チームの中村です。 本記事では、世間でも話題となっているPolarsについて基本的な使い方を抑えていきたいと思います。 私自身「データサイエンス100本ノック」をPolarsで一通り実施しましたので、それを元に実践に必要な使い方とノウハウをご紹介します。 本記事でPolarsの使い方とノウハウを習得し、実践的なテクニックを身につけて頂ければと思います。 Polarsとは pandasのようにデータフレーム形式を扱うライブラリで、高速で遅延評価可能などの特徴があります。 その他以下のような特徴があります。 indexがない、マルチカラムもない カラム名の重複不可(いい制約という意味で) pl.Exprという計算式で記述でき、実体化が不要 複雑な処理もワンライナーで書ける(df_tmpなど一時的な実体化が不要) 処理を文字列リテラルではなく関
QuestDB is the open-source time-series database for demanding workloads—from trading floors to mission control It delivers ultra-low latency, high ingestion throughput, and a multi-tier storage engine. Native support for Parquet and SQL keeps your data portable, AI-ready—no vendor lock-in. A few months back I was working on the primary-replica replication feature in QuestDB. The feature was nearin
PandasはPythonのデータ解析ライブラリです。 データの加工や集計、分析に皆様活用されていると思います。 最近ではPolarsというRustベースの高速データ解析ライブラリが登場し、こちらを利用する人も増えているのではないかと思います。 PolarsではApache Arrowという列指向のデータフォーマットをベースにしており、データの高速処理を実現しています。 そんな中、最近Pandasの2.0がプレリリースされたようです。 2.0では、Apache ArrowをPython操作できるようにしたライブラリPyArrowがPandasで使えるようになったようなので、どれだけ高速に処理できるのか早速試してみました。 参考:Pandas2.0の新機能 前提 Pandas2.0はプレリリース版を使用します。 (この記事を書いている2023/3/21時点では、まだ正式リリースされていないよ
はじめに🐍 pandas の DataFrame が遅い!高速化したい!と思っているそこのあなた! Polars の DataFrame を試してみてはいかがでしょうか?🦀 GitHub: https://github.com/pola-rs/polars User Guide: https://pola-rs.github.io/polars-book/user-guide/index.html API reference: https://pola-rs.github.io/polars/py-polars/html/reference/index.html この記事の目的 Polars の使い方をざっくり紹介。適当に例を並べていくので、雰囲気だけでもつかんでいただければ(系統立った説明はしてません。。) Polars のメリデメ 👍速い🚀🚀 ベンチマーク: https://
※結合(merge, join)は小野寺さん、冨山さんの発表の中で十分GPUの恩恵を受ける処理であることが自明だったので今回は省略しました。 処理速度を計測するためのデータセットは以下のコードで作成しました。 import pandas as pd import polars as pl import numpy as np import random from datetime import datetime, timedelta import time # データの行数 num_rows = 100_000_000 # データ生成関数 def generate_data(seed): # 乱数のシードを固定 np.random.seed(seed) random.seed(seed) # USER_ID列の生成 user_ids = np.random.randint(1, 1001,
import os import polars as pl import math from sklearn import preprocessing from sklearn import model_selection if not os.path.exists('../data/'): !git clone https://github.com/The-Japan-DataScientist-Society/100knocks-preprocess os.chdir('100knocks-preprocess/docker/work/answer') dtypes = { 'customer_id': str, 'gender_cd': str, 'postal_cd': str, 'application_store_cd': str, 'status_cd': str, 'cat
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