Movatterモバイル変換

[0]ホーム

انتقل إلى المحتوى

APOBEC3B

عدل الوصلات

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة

APOBEC3B

بنى متوفرة

بنك بيانات البروتين

Ortholog search:PDBe RCSB

قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
5CQD,5CQH,5CQI,5CQK,2NBQ

معرفات

أسماء بديلة

APOBEC3B, A3B, APOBEC1L, ARCD3, ARP4, DJ742C19.2, PHRBNL, bK150C2.2, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B

معرفات خارجية

الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607110 MGI:MGI:1933111 HomoloGene:105420 GeneCards:9582

علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	•hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines •ربط أيون الزنك •نشاط تحفيزي •نشاط هيدرولاز •ربط أيون فلزي •deoxycytidine deaminase activity •RNA binding •cytidine deaminase activity
مكونات خلوية	•نواة •سيتوبلازم
عمليات حيوية	•negative regulation of transposition •مناعة فطرية •immune system process •defense response to virus •cytidine deamination •cytidine to uridine editing •DNA demethylation
المصادر:Amigo /QuickGO

نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي

المزيد من بيانات التعبير المرجعية

تماثلات متسلسلة

أنواع

الإنسان

الفأر


Q9UH17


Q99J72

RefSeq (رنا مرسال.)


‏NM_001270411 NM_004900، ‏NM_001270411


‏NM_030255، ‏XM_006521553، ‏XM_017316806، ‏XM_017316808، ‏XR_001781583، ‏NM_001347041، ‏XM_036159640 NM_001160415، ‏NM_030255، ‏XM_006521553، ‏XM_017316806، ‏XM_017316808، ‏XR_001781583، ‏NM_001347041، ‏XM_036159640

RefSeq (بروتين)


‏NP_004891 NP_001257340، ‏NP_004891


‏NP_001333970، ‏NP_084531، ‏XP_006521616، ‏XP_017172295، ‏XP_017172297، ‏XP_036015533 NP_001153887، ‏NP_001333970، ‏NP_084531، ‏XP_006521616، ‏XP_017172295، ‏XP_017172297، ‏XP_036015533

الموقع (UCSC

n/a

Chr 15: 79.78 – 79.8 Mb

بحثببمد

APOBEC3B‏ (Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B) هوَبروتين يُشَفر بواسطةجين APOBEC3B فيالإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة

[عدل]

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهمفي توسيعه.(يوليو 2018)

الأهمية السريرية

[عدل]

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهمفي توسيعه.(يوليو 2018)

المراجع

[عدل]

^"Entrez Gene: APOBEC3B apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3B". مؤرشف منالأصل في 2010-12-05.
^Madsen P، Anant S، Rasmussen HH، Gromov P، Vorum H، Dumanski JP، Tommerup N، Collins JE، Wright CL، Dunham I، MacGinnitie AJ، Davidson NO، Celis JE (سبتمبر 1999). "Psoriasis upregulated phorbolin-1 shares structural but not functional similarity to the mRNA-editing protein apobec-1".J Invest Dermatol. ج. 113 ع. 2: 162–9.DOI:10.1046/j.1523-1747.1999.00682.x.PMID:10469298.
^Jarmuz A، Chester A، Bayliss J، Gisbourne J، Dunham I، Scott J، Navaratnam N (فبراير 2002). "An anthropoid-specific locus of orphan C to U RNA-editing enzymes on chromosome 22".Genomics. ج. 79 ع. 3: 285–96.DOI:10.1006/geno.2002.6718.PMID:11863358.

قراءة متعمقة

[عدل]

Wedekind JE، Dance GS، Sowden MP، Smith HC (2003)."Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business".Trends Genet. ج. 19 ع. 4: 207–16.DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4.PMID:12683974.
Dunham I؛ Shimizu N؛ Roe BA؛ وآخرون (1999). "The DNA sequence of human chromosome 22".Nature. ج. 402 ع. 6761: 489–95.DOI:10.1038/990031.PMID:10591208.{{استشهاد بدورية محكمة}}:الوسيط غير المعروف|name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام|name-list-style= (مساعدة)
Strausberg RL؛ Feingold EA؛ Grouse LH؛ وآخرون (2003)."Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences".Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903.DOI:10.1073/pnas.242603899.PMC:139241.PMID:12477932.{{استشهاد بدورية محكمة}}:الوسيط غير المعروف|name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام|name-list-style= (مساعدة)
Mariani R؛ Chen D؛ Schröfelbauer B؛ وآخرون (2003). "Species-specific exclusion of APOBEC3G from HIV-1 virions by Vif".Cell. ج. 114 ع. 1: 21–31.DOI:10.1016/S0092-8674(03)00515-4.PMID:12859895.{{استشهاد بدورية محكمة}}:الوسيط غير المعروف|name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام|name-list-style= (مساعدة)
Sawyer SL، Emerman M، Malik HS (2006)."Ancient Adaptive Evolution of the Primate Antiviral DNA-Editing Enzyme APOBEC3G".PLoS Biol. ج. 2 ع. 9: E275.DOI:10.1371/journal.pbio.0020275.PMC:479043.PMID:15269786.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Yu Q؛ Chen D؛ König R؛ وآخرون (2005). "APOBEC3B and APOBEC3C are potent inhibitors of simian immunodeficiency virus replication".J. Biol. Chem. ج. 279 ع. 51: 53379–86.DOI:10.1074/jbc.M408802200.PMID:15466872.{{استشهاد بدورية محكمة}}:الوسيط غير المعروف|name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام|name-list-style= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Gerhard DS؛ Wagner L؛ Feingold EA؛ وآخرون (2004)."The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)".Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7.DOI:10.1101/gr.2596504.PMC:528928.PMID:15489334.{{استشهاد بدورية محكمة}}:الوسيط غير المعروف|name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام|name-list-style= (مساعدة)
Rose KM، Marin M، Kozak SL، Kabat D (2005). "Regulated production and anti-HIV type 1 activities of cytidine deaminases APOBEC3B, 3F, and 3G".AIDS Res. Hum. Retroviruses. ج. 21 ع. 7: 611–9.DOI:10.1089/aid.2005.21.611.PMID:16060832.
Bogerd HP؛ Wiegand HL؛ Doehle BP؛ وآخرون (2006)."APOBEC3A and APOBEC3B are potent inhibitors of LTR-retrotransposon function in human cells".Nucleic Acids Res. ج. 34 ع. 1: 89–95.DOI:10.1093/nar/gkj416.PMC:1326241.PMID:16407327.{{استشهاد بدورية محكمة}}:الوسيط غير المعروف|name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام|name-list-style= (مساعدة)
Stenglein MD، Harris RS (2006). "APOBEC3B and APOBEC3F inhibit L1 retrotransposition by a DNA deamination-independent mechanism".J. Biol. Chem. ج. 281 ع. 25: 16837–41.DOI:10.1074/jbc.M602367200.PMID:16648136.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Hakata Y، Landau NR (2007). "Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains".J. Biol. Chem. ج. 281 ع. 48: 36624–31.DOI:10.1074/jbc.M604980200.PMID:17020885.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Kidd JM؛ Newman TL؛ Tuzun E؛ وآخرون (2007)."Population Stratification of a Common APOBEC Gene Deletion Polymorphism".PLoS Genet. ج. 3 ع. 4: e63.DOI:10.1371/journal.pgen.0030063.PMC:1853121.PMID:17447845.{{استشهاد بدورية محكمة}}:الوسيط غير المعروف|name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام|name-list-style= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)

An APOBEC cytidine deaminase mutagenesis pattern is widespread in human cancers

Steven A Roberts,Michael S Lawrence,Leszek J Klimczak,Sara A Grimm,David Fargo, Petar Stojanov,Adam Kiezun,Gregory V Kryukov,Scott L Carter,Gordon Saksena,Shawn Harris,Ruchir R Shah,Michael A Resnick,Gad Getz& Dmitry A Gordenin

Candace D Middlebrooks, A Rouf Banday, Konichi Matsuda, et al. Association of germline variants in the APOBEC3 region with cancer risk and enrichment with APOBEC-signature mutations in tumors Exit Disclaimer. Nature Genetics 2016.

معرفات مركب كيميائي	قاعدة بيانات التتابع المرجعي (RefSeq RNA) 1 2

ع ن ت جينات الكروموسوم 22
جينات الكروموسوم 22	MTMR3 NOL12 ASCC2 CYTH4 MEI1 GRAMD4 MKL1 SEPT5 NFAM1 ARVCF MRPL40 HIC2 DNAL4 GAS2L1 EIF3D TBC1D10A H1F0 MYO18B ADM2 RASD2 CABIN1 CRYBB1 SBF1 CENPM RBM9 PLXNB2 KDELR3 GNAZ RAB36 SMTN HPS4 DGCR6 SMCR7L DGCR14 CRELD2 PARVG SEC14L2 EIF4ENIF1 SNRPD3 TFIP11 TOB2 CRYBA4 MCM5 CRYBB3 CTA-126B4.3 DGCR8 KREMEN1 KIAA0930 PARVB APOBEC3D AP1B1 TRIOBP CECR1 ZNF74 UPK3A TTC28 TIMP3 GCAT EIF3EIP PES1 MLC1 Galectin-2 CLDN5 SAMM50 TNRC6B MIRLET7BHG ARFGAP3 SF3A1 APOBEC3B MORC2 CDC42EP1 MAPK8IP2 Derlin-3 APOBEC3H APOL3 TOM1 SFI1 PDGFB VPREB3 Galectin-1 RSPH14 TCF20 TUBGCP6 L3MBTL2 UFD1L SEZ6L APOL6 HORMAD2 UNC84B DRG1 THAP7 PATZ1 TMEM184B EFCAB6 SCUBE1 SLC5A4 PITPNB GTPBP1 APOBEC3F CSDC2 SLC2A11 CRYBB2 SYNGR1 DGCR2 LDOC1L SGSM1 SEPT3 SYN3 LZTR1 OSBP2 APOL2 POLR2F CBY1 NCAPH2 FBXO7 TOMM22

جينات الكروموسوم 22

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM):607110
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID:ENST00000402182 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI):C1424925

هذهبذرة مقالة عنبروتين بحاجة للتوسيع. فضلًاشارك في تحريرها.

مجلوبة من «https://ar.wikipedia.org/w/index.php?title=APOBEC3B&oldid=65727815»

تصنيف:

جينات على كروموسوم 22

تصنيفات مخفية:

[8]ページ先頭