分かりづらい例はググれば出てくるから具体例は略するが、
JSONはキーをクオートしたりケツカンマかけなかったりコメントかけなかったり、不便点あるのはわかるが、改良されたJSON5だとかJSONCだとかある
構造的に深くなって人が見づらいならTOMLというのもある
インデントはすっきりしてるかもしれないが、意図せずズレても気づきづらい
ホワイトスペースは崩れやすく、一度崩れたのを直すのはかなり大変だ
Pythonもインデントベースだが、こっちはプログラミング言語でロジックを記載してるわけだから実行時やテストでおかしくなってることは検出しやすいのでまだマシ
他にもYAMLは便利機能として名前をつけておいて他の場所で参照したりインポートしてマージするようなこともできるが、これがさらにわかりづらくしてる
データ構造なのに考えないとどうなってるかわからず直感的でない