いよいよ迎えたヒャッコクジム戦！今度のジム戦は2対2のダブルバトル！2体のニャオニクスで息のあったコンビネーションをみせるジムリーダー、ゴジカに対し、サトシはゲコガシラとファイアローの２体で対抗する！ニャオニクスの“みらいよち”に苦戦するゲコガシラとファイアロー、その時、サトシが閃いた作戦とは！？

セレナのトライポカロン挑戦も無事終わり、いよいよ次はサトシのヒャッコクジム挑戦だ！ジムに向かう途中、ヒャッコクシティのシンボル、日時計の近くを通った一行は、謎の女性に襲撃をうけるプラターヌ博士と助手達を目撃する。助けに入ったサトシ達に謎の女性はカロスを救う為だ、と言って突然バトルを仕掛けてきた！

ヒャッコクシティに到着したサトシ達、まずはセレナがトライポカロン・ヒャッコク大会に挑戦だ！今回もサナにムサヴィそしてネネ、手強いライバル達が集結し、不安に感じつつも気合を入れなおすセレナ。無事テーマパフォーマンスを突破するものの、何とフリーパフォーマンス直前にあのポケモンが迷子になってしまう！

7個目のバッジゲットとトライポカロン挑戦のため、ヒャッコクシティへ向かう途中、同じくトライポカロンヒャッコク大会に出場するサナと、応援のティエルノが合流し、ますます気合の入るセレナ。しかし、どうやらセレナには何やら悩みがあるようだ。それはどうやら、つい最近ゲットしたばかりのあのポケモンのことのようで・・・？

次のトライポカロンへ向けて、パフォーマンスの練習にも力が入るセレナ。ある日、花畑の中で楽しそうに踊るイーブイを見つける。イーブイの美しいダンスに感動したセレナは、何とかしてイーブイをゲットして一緒にトライポカロンに出て欲しいと願うが････果たしてセレナの想いはイーブイに伝わるのか！？

とある森でロケット団に襲われ、落とし穴にはまってしまったサトシ達。ロケット団の撃退には成功したものの、バトルの余波で地面に穴があき、地下に落っこちてしまう。するとユリーカが、前にも同じような経験をしたと言い出す。どうやらその出来事は、シトロンがホルビーをゲットするきっかけとなった出来事のようで・・・？

ある夜、目が覚めたユリーカは迷子のチゴラスを助ける。一先ずユリーカがお世話をすることになったのだが、このチゴラス、身体は大きいのにとっても甘えん坊！お世話するのも一苦労。そんな時、チゴラスを狙ってロケット団が現れた！チゴラスを助けようとしたユリーカが大ピンチ！？その時チゴラスに異変が･･･！？

旅の途中で、トロバと再会したサトシ達。ポケモンフォトコレクターを目指すトロバは、近くの火山に伝説のポケモン、ファイヤーがいるとの噂を聞きつけ、やって来たのだという。伝説のポケモンに会えるかも！とサトシ達も大興奮。ところがロケット団の妨害がはいり大ピンチ！その時、怪しい鳴き声が周囲に響き渡り･･･!?

ヒャッコクシティへの旅を続けるサトシ達、セレナは次のトライポカロンに向けて練習にも熱が入る。そんな時、練習中の事故が原因でテールナーの小枝が折れてしまう。みんなで変わり小枝を探したが、テールナーは頑なに折れた小枝にこだわりをみせる。テールナーの小枝に秘められた約束とは･･･？

旅の途中、雨が降ってきてポケモンセンターで休憩することにした一行。しかし雨漏りが原因で機械が故障し、停電してしまう。シトロンが修理しようと奮闘するが、部品が足りなくて直せない!!そこでハリマロンとホルビーが買ってくることになったのだが･･･？果たしてハリマロンは無事はじめてのおつかいを達成できるのか!?