A formação do deserto é devida, principalmente, acorrente marítima fria de Benguela,[5] que atua na costa sudoeste daÁfrica, condensando ovapor de água que vai em direção ao continente, fazendo com que as massas de ar cheguem mais secas ao mesmo.[5] O Calaári possui vasta área coberta por areia avermelhada sem afloramento de água em caráter permanente.[5] Porém Calaári não é um deserto verdadeiro.[5] Partes dele recebem mais de 250 mm de chuva mal distribuída anualmente e possuem bastante vegetação.[5] É realmente árido somente no sudoeste (menos de 175 mm de chuva ao ano),[5] fazendo do Calaári um deserto de fósseis. As temperaturas no verão do Calaári vão de 20 a 40°C. No inverno, o Calaári tem um clima seco e frio com geada à noite. As baixas temperaturas doinverno podem ficar abaixo de 0°C.
O clima no verão em algumas regiões do Calaári pode alcançar 50°C (por isso algumas tribossãs ecóis se recolhem nos momentos mais quentes do dia).[6]
A flora do Calaári apresenta árvores dispersas, como palmeiras e baobás, entre muitas formações arbustivas, matagais xerófitos e herbáceos próprias da savana.[5] Embora pouco desenvolvida em toda a extensão do território, a flora é mais densa no norte.[5] Já no centro, no sul e, principalmente, no sudoeste há uma vasta área coberta por areia avermelhada sem afloramento de água em caráter permanente.[5]
A fauna é constituída principalmente por suricatas e hienas.[7]
