Lasystématique (spécifiquement :biosystématique ousystématique biologique[1]) est une discipline dessciences naturelles[2] et de l'histoire naturelle, qui a pour objet d'inventorier tous les organismes vivants, existants ou ayant existé. Pour cela, elle doit :
Les nommer sans ambiguïté, au moyen d'unbinôme (ou trinôme) latin, en fonction des règles denomenclature ;
Rassembler les espèces ayant des caractères en commun« à l'intérieur d'entités hiérarchisées prédéfinies » :genre,famille,ordre,classe,division,règne. De tels groupes sont appeléstaxons et la branche de la systématique qui s'occupe de donner ces noms est lataxinomie.
Il s'agit d'une véritable science à l'origine de labotanique, de lazoologie, de lamycologie. Elle est ouverte vers l'avenir, la tâche à accomplir restant immense, avec près d'un quart des espèces dephanérogames restant à découvrir, nommer, décrire, comprendre, et bien davantage encore d'insectes.
DepuisCarl von Linné (1707-1778), le naturaliste suédois fondateur de la systématique moderne, de nouvelles branches ont vu le jour, comme laphylogénie : étude des mécanismes de l'évolution, ou labiosystémique : amélioration, transformation et extension de l'aire des plantes cultivées, conservation de labiodiversité…
La systématique (1° d'emblée, automatiquement, action de faire quelque chose déterminé à l'avance, 2° Science des classifications des êtres vivants) n'est passynonyme detaxinomie (aussi appelée taxonomie), qui s'attache à décrire et définir les taxons, mais l'un de ses prolongements. La confusion entre les deux termes vient du fait que les taxinomistes ont de tout temps été également nommés systématiciens car, après avoir étudié et décrit des organismes, ils ont naturellement essayé de les classer à partir dubas niveau desespèces (alpha taxonomy ou « taxinomie primaire »).
Dans la pratique, le terme « systématique » désigne aussi bien la méthode utilisée (on dira par exemple la « systématique phylogénétique ») que le résultat obtenu avec cette méthode (exemple : la « systématique desAgaricales »). Dans le sens concret de résultat, les deux sciences sont peu distinctes et souvent confondues, car pratiquées simultanément par les mêmes personnes ; Ceux qui utilisent surtout le sens de méthode, lesphylogénéticiens notamment, nomment souvent le résultatclassification ou encore « taxinomie ».
Les espèces animales et végétales ont été très tôt regroupées sur la base de rapprochements anatomiques et comportementaux ou selon les ou des milieux qu'elles habitent (aquatiques par exemple).
Après l'apparition du concept de l'évolution et de la disparition d'espèces ayant antérieurement existé, la classification tend à être présentée de manièreheuristique et arborescente. Certains comme le zoologistePaul Bert auXIXe siècle[3] utilisent aussi comme outil pédagogique lamétaphore de l'adressage postal« enpoupée russe » de typemonde, continent, pays, ville, rue, maison...[3]
Laclassification classique du vivant classe les êtres vivants selon une hiérarchie de groupes de plus en plus vastes.
Les progrès de lagénétique ont conduit à revoir le classement de certains taxons dans l'arbre phylogénétique du Vivant. Les approchessystémiques et fonctionnelles de labiodiversité tendent à prendre de l'importance, mais la systématique reste fondamentale pour inventorier et pour évaluer l'évolution au sein du Vivant. Le développement de l'informatique a donné naissance à labio-informatique, et permis un travail collaboratif (par exemple à l'origine du réseauTela Botanica qui associe environ 28 000 botanistes francophones dans 35 pays (fin 2016)[4]. À titre d'exemple, un logiciel d'identification des plantes assistée par ordinateur (IDAO[5]) permet à des non-spécialistes d'identifier plus rapidement une plante sans passer par une complexeclé de détermination hiérarchique, sur la base d'une méthode de type « portrait-robot » de plantes. Cela facilite l'identification des plantes par des « amateurs » (ouparataxonomistes). Il est aussi utilisé par le logicielPl@ntNet, développé conjointement par l'Université de Montpellier, l'INRIA, leCIRAD, l'INRA et Tela Botanica. De nombreuses études basées sur des protocoles de type « Sciences citoyennes » sont en développement dans le monde.
