La phototrophie n'est pas le seul mode de vieautotrophe. Lachimiotrophie est un mode caractéristique des organismes qui tirent leur énergie de la transformation demolécules.
Le mécanisme de la photosynthèse implique l'existence d'un donneur d'électrons, unréducteur afin deréduire le « carbone minéral », (se présentant essentiellement sous forme deCO2) en « carbone organique ». Selon la nature de ce donneur, on distingue deux sous-classes de phototrophes : lesphotolithotrophes, où le donneur d'électrons est une molécule « minérale », par exempleH2O,H2S ouH2 ; et lesphotoorganotrophes, chez qui le donneur d'électrons est une molécule « organique ».