Spécialiste de laGascogne médiévale à laquelle il est lié par ses origines familiales, et en particulier de laHaute Lande, Jean Bernard Marquette consacre beaucoup de ses travaux à laMaison d'Albret[5].
En complément de sa thèse, Jean Bernard Marquette édite un recueil de sources, un volume d'actes de la Maison d'Albret[9]. Selon l'historienne Kathleen Major,« The edition conforms to the usual impeccable standard of the series »[10]. Par ailleurs, l'historien Willy Steurs relève que ces documents« présentent un intérêt de premier ordre pour l'histoire économique, sociale, politique ou institutionnelle de Bordeaux et du Bordelais »[11].
Jean Bernard Marquette publie des études degéographie historique sur les paroisses, les villes, etc.[2],. Il publie une centaine d'articles sur les pays landais[5]. Participant à l'édition et à l'étude duLivre rouge de lacathédrale de Dax, il décrit la géographie de cediocèse[12], plus précisément son réseau de paroisses[13].
À partir de 1982, il dirige la collection de l’Atlas historique des villes de France, prenant la suite de Philippe Wolff et de Charles Higounet. Cette collection relève de la Commission internationale pour l’histoire des villes[14],[4] dont Jean Bernard Marquette est membre[4],[3]. En 2020, cette collection compte une cinquantaine de volumes[15], publiés à partir de 1982. Au total, quarante-huit fascicules sont édités sous la direction de Jean Bernard Marquette, d'abord par le CNRS puis par les éditions Ausonius, couvrant différentes régions :Midi-Pyrénées,Aquitaine,Bretagne,Lorraine etFranche-Comté[14],[16],[3]. Il est aussi un acteur du développement des études d'archéologie médiévale[17], notamment decastellologie[18],[3].
De 1989 à 2007, Jean Bernard Marquette co-dirige lesAnnales du Midi avec Michel Taillefer[4],[3]. En 1990, il dirige avecPierre Bonnassie la publication d'un numéro remarqué[19] desAnnales du Midi dédié à la mémoire de Charles Higounet[20]. Membre fondateur de l'association les Amis du Bazadais, Jean Bernard Marquette en dirige la revue,Les Cahiers du Bazadais de 1961 à 2015[5],[4],[3]. Il collabore à plusieurs livres d’histoire générale ou régionale[2].
Son dernier ouvrage est consacré à un vignoble prestigieux dePessac, lechâteau Pape Clément. Selon la critique, ce livre« trouvera sa place, par la richesse des informations fournies à ce sujet, parmi les incontournables de l’historiographie du vignoble bordelais à la fin du Moyen Âge. »[21].
Jacques Boisgontier et Jean Bernard Marquette (édition),Bernard Vigneau. Lexique du gascon parlé dans le Bazadais 1879, Bazas, Les Amis du Bazadais,, 345 p.
André Klingebiel et Jean Bernard Marquette (dir.),La Grande Lande. Histoire naturelle et géographie historique : Actes du colloque de Sabres, 27-29 novembre 1981, Paris, éditions du CNRS et du Parc naturel régional des Landes de Gascogne,, 604 p.[23].
Jean Cabanot, Jean Bernard Marquette etBernadette Suau,Guide pour la visite de quelques églises anciennes de Chalosse, Amou, Aulès, Baigts, Mont-de-Marsan, Amis des églises anciennes des Landes,, 56 p.(BNF34992451).
Pierre Bonnassie et Jean Bernard Marquette (dir.),Annales du Midi : revue archéologique, historique et philologique de la France méridionale : Cadre de vie et société dans le Midi médiéval : hommage à Charles Higounet.,t. 102, Toulouse,Privat (no 189-190),(lire en ligne)[19].
André Klingebiel et Jean Bernard Marquette (dir.),La Grande Lande: géographie historique : Actes du colloque tenu au Teich au Centre Permanent d'Initiation à l'Environnement, 19 - 20 octobre 1985, Presses Universitaires de Bordeaux,, 215 p.(ISBN978-2-86781-126-5,lire en ligne).
↑a etbJean-Pierre Chapuisat, « Le trésor des chartes d'Albret, tome I: Les archives de Vayres, première partie: Le fonds de Langoiran [Jean-Bernhard Marquette] »,Zeitschrift: Schweizerische Zeitschrift für Geschichte = Revue suisse d'histoire = Rivista storica svizzera,vol. 24,no 2,,p. 307-308(lire en ligne).
↑Pierre Bonnassie et Jean Bernard Marquette (dir.),Annales du Midi : revue archéologique, historique et philologique de la France méridionale : Cadre de vie et société dans le Midi médiéval : hommage à Charles Higounet.,t. 102, Toulouse,Privat (no 189-190),(lire en ligne).
↑ThomasLabbé, « Jean-Bernard Marquette, De la vigne du pape au Château Pape Clément »,Crescentis. Revue internationale d'histoire de la vigne et du vin,no 4,(ISSN2647-4840,lire en ligne, consulté le).
↑Marie-Madeleine Gauthier,« Uzeste, l'église Notre-Dame, ancienne collégiale, et le tombeau de Bertrand de Got, pape sous le nom de Clément V (1305-1314) », dansCongrès archéologique de France : 145e session, 1987. Bordelais et Bazadais, Paris, Société française d'archéologie,, 375 p.(lire en ligne),p. 271-324.
↑PhilippeRoudié, « Une approche pluridisciplinaire de la Grande Lande : La Grande Lande. Histoire naturelle et géographie historique. Actes du colloque de Sabres, 27-29 novembre 1981, Éd. du C.N.R.S. et du Parc naturel régional des Landes de Gascogne, 1985 »,Annales du Midi,vol. 100,no 184,,p. 510–513(lire en ligne, consulté le).