De 1896 à 1899, il enseigne à Paris (lycée Condorcet, puislycée Montaigne), puis aux lycées deChâteauroux et dePoitiers. À la rentrée 1899, il est nommé maître de conférences de langue et littérature latines à la faculté des lettres de Rennes, puis, l'année suivante, à celle de Lille. Il devient professeur adjoint en 1903, professeur de philologie latine (1906), puis de langue et littérature latines toujours à la faculté des lettres de Lille de 1913 à sa mort en 1935.
Henri Bornecque s'est surtout illustré comme éditeur et traducteur de nombreuses œuvres de la littérature latine[1] :Cicéron,Macrobe,Ovide,Quintilien,Pline le Jeune,Sénèque le Rhéteur,Tacite. Il est aussi l'auteur de nombreux ouvrages à caractère pédagogique ou méthodologique concernant le latin : grammaire, conseils pour les épreuves de version et de thème, etc. ; le plus connu est sans doute son dictionnaire pour les candidats au baccalauréat.
Les déclamations et les déclamateurs d'après Sénèque le Père (coll. « Travaux et mémoires de l'Université de Lille »), Lille, 1902, 214 p.
Les clausules métriques latines (coll. « Travaux et mémoires de l'Université de Lille »), Lille, 1907, XVIII-616 p.
Rome et les Romains : littérature, histoire, antiquités publiques et privées (en collab. avecDaniel Mornet), Paris, Delagrave, 1912, VII-238 p. (nombreuses rééd.).
Tite-Live, Paris, Boivin & Cie,
Le Dictionnaire latin-français du baccalauréat (en collab. avec Fernand Cauët), Paris, Belin, 1936 (nombreuses rééd.).
Les « Catilinaires » de Cicéron : étude et analyse, Paris, Mellottée,, 348 p.(lire en ligne)
La France d’aujourd’hui (en collab. avec Benno Rottgers), Vienne, Tempsky ; Leipzig, G. Freytag, 1910, 258 p., ill.
Jean-François Condette,Les lettrés de la République : les enseignants de la Faculté des lettres de Douai puis Lille sous la Troisième République (1870-1940) : dictionnaire biographique, Lille, Université Charles-de-Gaulle-Lille 3, 2006