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Bacteroidota

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Bacteroidota
Description de cette image, également commentée ci-après
B. fragilis (ici observées aumicroscope optique aprèscoloration de Gram) est uneespèce du phylum desBacteroidota
Classification
DomaineBacteria
RègnePseudomonadati

Phylum

Bacteroidota
Krieget al.2021[1]

Synonymes

LesBacteroidota (anc.Bacteroidetes) sont unphylum durègne desPseudomonadati au sein dudomaineBacteria. Son nom provient deBacteroides qui est legenre type de ce phylum.

Cesbactéries sont largement répandues dans l'environnement, notamment dans le sol, dans lessédiments, l'eau de mer et dans lesintestins d'animaux.

Introduction

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De loin, la classe desBacteroidales est l'une des plus étudiées, notamment les genresBacteroides (organismes abondants dans les selles des animaux àsang chaud, dont leshumains) etPorphyromonas (un groupe d'organismes vivant dans la cavité buccale de l'Homme)[réf. nécessaire].

Les membres du genreBacteroides sont des agentspathogènes opportunistes, rarement membres des deux autres classes de pathogènes pour l'Homme[réf. nécessaire].

Le chercheurJeffrey Gordon et ses collègues ont constaté que laflore intestinale des humainsobèses possède un pourcentage plus faible debactéries du phylumBacteroidetes. Toutefois, ils ne savent pas si lesBacteroidetes peuvent prévenir l'obésité ou si cetteflore intestinale n'est pas simplement préférée par l'intestin chez les personnes non obèses[2],[3],[4].

Taxonomie

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Étymologie

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L'étymologie du nom du phylumBacteroidota est la suivante :Bac.te.ro.i.do’ta N.L. masc. n.Bacteroides, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff.-ota, suffixe pour désigner un phylum; N.L. neut. pl. n.Bacteroidota, le phylum desBacteroides[5].

Nomenclature

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Ce phylum est proposé dès 2010 par N.R. Krieget al. dans la deuxième édition deBergey's Manual of Systematic Bacteriology sous le nom de « Bacteroidetes »[6]. Ce n'est qu'en 2021 qu'il est publié de manière valide par Oren etGarrity[1] après un renommage conforme au code denomenclature bactérienne (le nom du phylum devant être dérivé de celui de son genre type, en l'occurrenceBacteroides, par adjonction du suffixe-ota conformément à une décision de l'ICSP en 2021[7]).

Liste des classes

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SelonLPSN(18 avril 2025)[8] ce phylum comporte les classes suivantes :

Notes et références

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  1. a etb(en) AOren et GMGarrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. »,Int J Syst Evol Microbiol,vol. 71,no 10,‎,p. 5056(DOI 10.1099/ijsem.0.005056)
  2. (en) Ley R, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone C, Knight R, Gordon J, « Obesity alters gut microbial ecology »,Proc Natl Acad Sci U S A,vol. 102,no 31,‎,p. 11070–5(PMID 16033867,DOI 10.1073/pnas.0504978102)
  3. (en) Ley R, Turnbaugh P, Klein S, Gordon J, « Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity »,Nature,vol. 444,no 7122,‎,p. 1022–3(PMID 17183309,DOI 10.1038/4441022a)
  4. (en) Turnbaugh P, Ley R, Mahowald M, Magrini V, Mardis E, Gordon J, « An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest »,Nature,vol. 444,no 7122,‎,p. 1027–31(PMID 17183312,DOI 10.1038/nature05414)
  5. (en) « Phylum Bacteroidota », surLPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature(consulté le)
  6. Krieg NRet al. « Phylum XIV. Bacteroidetes phyl. nov. » In : Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ, Ward NL, Ludwig W & Whitman WB (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2ème édition, vol. 4 (The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes). Springer, New York, 2010.https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-68572-4_3
  7. Oren Aet al. « Emendation of Rules 5b, 8, 15 and 22 of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes to include the rank of phylum »Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(6):004851.Accès libre.
  8. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 18 avril 2025.

Liens externes

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