Il développe les idées de son oncleBernard de Jussieu sur la classification des végétaux suivant un système basé sur la morphologie des plantes. En1774, il fait paraître sonExposition d'un nouvel ordre des plantes, adopté dans les démonstrations du Jardin royal dans lesMémoires de l'Académie des sciences, complétée quinze ans plus tard par sonGenera plantarum secundum ordines naturales disposita.
Georges Cuvier en parlera comme d'«un livre admirable, qui fait dans les sciences d'observation une époque peut-être aussi importante que la chimie de Lavoisier dans les sciences d'expérience ». La méthode employée par Antoine-Laurent dans sonGenera Plantarum sera reprise en zoologie par Cuvier avec saloi de subordination des organes, et affinée puis formalisée parAugustin Pyrame de Candolle, qui la complétera en apportant de nouvelles distinctions dans la classification. Cette œuvre est à la base de toute la classification actuelle desvégétaux supérieurs ; en effet, on y retrouve la majorité des genres et familles décrites par Antoine-Laurent, qui ont été postérieurement corrigées et/ou complétées, puis enfin confortées par les résultats de laphylogénie.
En1794, il est nommé directeur du nouveauMuséum national d'histoire naturelle, et il y fonde immédiatement une bibliothèque. En1804, il occupe la chaire de Professeur de botanique à la faculté de médecine de Paris, il y restera jusqu'en1826. En1829, il devient membre étranger de laRoyal Society. Devenu presque aveugle, il se démet de sa chaire au Muséum au profit de son filsAdrien.
1770 :An aeconomiam animalem inter et vegetalem analogiae ouComparaison de la structure et des fonctions des organes végétaux avec les phénomènes de la vie animale (Thèse défendue devant la faculté de médecine de Paris)
1773 :Mémoire sur la famille des renonculacées Dans :Histoire de l'Académie Royale des Sciences. Année 1773. Paris 1777,p. 214–240(en ligne).
1774 :Exposition d'un nouvel ordre de plantes adopté dans les démonstrations du Jardin royal Dans :Histoire de l'Académie Royale des Sciences. Année 1774. Paris 1777,p. 175–197(en ligne).
1788-89 :Genera Plantarum, secundum ordines naturales disposita juxta methodum in Horto Regio Parisiensi exaratam. Paris 1789(en ligne).
[1824] « Principes de la méthode naturelle des végétaux » (51 p.),Dictionnaire des sciences naturelles, Paris, F.G. Levrault,vol. 30,(lire en ligne [surgallica]).
Notice Historique sur le Museum d’Histoire Naturelle. Dans :Annales du Museum d’Histoire Naturelle. Paris 1802–1808:
Méthode Naturelle des Végétaux. Dans :Dictionnaire des Sciences Naturelles. Tome 30, Straßburg/Paris 1824,p. 426–468(en ligne).
Introductio in historiam plantarum. Dans :Annales des Sciences Naturelles. Botanique. 2. partie, Tome 8, 1837,p. 97–160 etp. 193–239(en ligne). - publié à titre posthume
Mémoire sur les caractères généraux de familles tirés des graines, et confirmés ou rectifiés par les observations de Gautner.
Dans :Annales du Museum d’Histoire Naturelle. Paris 1804–1813:
Adolphe Brongniart:Notice historique sur Antoine-Lairent de Jussieu. InAnnales des sciences naturelles. Botanique. 2. Folge, Band 7, 1837, S. 5–24(en ligne).
Pierre Flourens:Éloge historique d’Antoine-Laurent de Jussieu., dansMémoires de l'Académie des sciences de l'Institut de France, lu le, Gauthier-Villars, Paris, 1840, tome 17,p. III-LX(lire en ligne).
Georg August Pritzel:Thesaurus literaturae botanicae. F. A. Brockhaus, Leipzig 1872–[1877] S. 160(en ligne).
Frans A. Stafleu:Jussieu, Antoine-Laurent De. Dans:Complete Dictionary of Scientific Biography. Band 7, Charles Scribner's Sons, Detroit 2008, S. 198–199(en ligne).
Frans Antonie Stafleu, Richard Sumner Cowan:Taxonomic literature. A selective guide to botanical publications and collections with dates, commentaries and types. Band 2: H–Le, 2. Auflage. Utrecht 1979,(ISBN90-313-0343-7), S. 477–479(en ligne).
Peter Francis Stevens:The Development of Biological Systematics. Antoine-Laurent de Jussieu, Nature, and the Natural System. Columbia University Press, New York 1994,(ISBN0-231-06440-3).
