Zur Kenntnis des Primordial-Craniums der Amphibien und Reptilien. (Regarding the primordial cranium ofamphibians andreptiles) In: Verh. Anat. Ges. 5: 114–120, 1891.
A. Ecker's und R. Wiedersheim's Anatomie des Frosches, Auf Grund eigener Untersuchungen durchaus neu bearbeitet (Alexander Ecker's andRobert Wiedersheim'sAnatomy of Frogs, a new edition by Ernst Gaupp); 2 and 3 Aufl. 1896, 1904.
Alte Probleme und neuere Arbeiten ueber den Wirbeltierschaedel (Old problems and new research on the vertebrate cranium). In: Erg. Anat. Entw. 10: 847–1001, 1900.
Die Reichertsche Theorie, Hammer-, Amboss- und Kieferfrage. (The Reichert theory,hammer-,anvil- andjaw question) In: Arch. Anat. Suppl. 1912: 1–416
"This article is based on a translation of an equivalent article at theGerman Wikipedia", source listed as:E. Fischer: Ernst Gaupp In: Anatomischer Anzeiger. 1917, 49, S. 584–591.