| dbo:abstract | - Intrinsic, or rho-independent termination, is a process in prokaryotes to signal the end of transcription and release the newly constructed RNA molecule. In prokaryotes such as E. coli, transcription is terminated either by a rho-dependent process or rho-independent process. In the Rho-dependent process, the rho-protein locates and binds the signal sequence in the mRNA and signals for cleavage. Contrarily, intrinsic termination does not require a special protein to signal for termination and is controlled by the specific sequences of RNA. When the termination process begins, the transcribed mRNA forms a stable secondary structure hairpin loop, also known as a Stem-loop. This RNA hairpin is followed by multiple uracil nucleotides. The bonds between uracil and adenine are very weak. A protein bound to RNA polymerase (nusA) binds to the stem-loop structure tightly enough to cause the polymerase to temporarily stall. This pausing of the polymerase coincides with transcription of the poly-uracil sequence. The weak adenine-uracil bonds lower the energy of destabilization for the RNA-DNA duplex, allowing it to unwind and dissociate from the RNA polymerase. Overall, the modified RNA structure is what terminates transcription. Stem-loop structures that are not followed by a poly-uracil sequence cause the RNA polymerase to pause, but it will typically continue transcription after a brief time because the duplex is too stable to unwind far enough to cause termination. Rho-independent transcription termination is a frequent mechanism underlying the activity of cis-acting RNA regulatory elements, such as riboswitches. (en)
- Rho-onafhankelijke transcriptie-terminatie of intrinsieke terminatie is een mechanisme bij prokaryoten, dat ervoor zorgt dat de RNA-transcriptie stopt en de nieuwe RNA-streng van het DNA loslaat. Door dit mechanisme bevat het mRNA een sequentie dat met zichzelf kan paren en zo een haarspeldstructuur van 7 -20 basenparen vormt. Deze structuur is rijk aan cytosine-guanine basenparen. C-G basenparen hebben een duidelijke basestapelinginteractie (speciaal de G-C basenparen) en kunnen door hun drie waterstofbruggen een stabile RNA-duplex vormen, waardoor het stabieler is dan de DNA-RNA-hybride. Het resultaat is dat de DNA-RNA-hybride van 8 basenparen van het transcriptiecomplex overgaat in een 4basenpaar-hybride. Deze 4bp-hybride heeft een zwakke A-U (adenine-uracil)-basenparing, waardoor het volledige RNA-transcript loslaat van het DNA. (nl)
- Внутренняя терминация, также ρ-независимая терминация, ро-независимая терминация (англ. Rho-independent termination), — механизм остановки транскрипции гена у прокариот. Суть этого механизма такова: мРНК содержит гуанин-цитозин-обогащённую последовательность, которая может образовывать структуры типа шпилька в 7—20 пар оснований в длину. Гуанин и цитозин образуют друг с другом три водородные связи и поэтому связаны довольно прочно. Сразу после шпильки располагается участок, обогащённый урацилом. Связи между урацилом и аденином очень слабы. Белок, связанный с РНК-полимеразой (nusA), настолько прочно связывается со шпилькой, что это вызывает временную остановку полимеразы и прекращение транскрипции. В этот момент полимераза располагается на полиурациловом участке последовательности. Слабые аденин-урациловые связи снижают энергию дестабилизации дуплекса РНК-ДНК, что позволяет им ослабить напряжение полинуклеотидной цепи и диссоциировать от РНК-полимеразы. Ро-элементы, которые не содержат полиурациловой последовательности, способны приостановить РНК-полимеразу, но она, как правило, продолжает транскрипцию спустя некоторое время, поскольку дуплекс слишком стабилен, чтобы вызвать диссоциацию РНК-полимеразы и последующую терминацию. Ро-независимая терминация транскрипции — это частый случай механизма, лежащего в основе активности цис-регуляторных элементов РНК, таких как рибопереключатели. (ru)
|
| rdfs:comment | - Intrinsic, or rho-independent termination, is a process in prokaryotes to signal the end of transcription and release the newly constructed RNA molecule. In prokaryotes such as E. coli, transcription is terminated either by a rho-dependent process or rho-independent process. In the Rho-dependent process, the rho-protein locates and binds the signal sequence in the mRNA and signals for cleavage. Contrarily, intrinsic termination does not require a special protein to signal for termination and is controlled by the specific sequences of RNA. When the termination process begins, the transcribed mRNA forms a stable secondary structure hairpin loop, also known as a Stem-loop. This RNA hairpin is followed by multiple uracil nucleotides. The bonds between uracil and adenine are very weak. A protei (en)
- Rho-onafhankelijke transcriptie-terminatie of intrinsieke terminatie is een mechanisme bij prokaryoten, dat ervoor zorgt dat de RNA-transcriptie stopt en de nieuwe RNA-streng van het DNA loslaat. Door dit mechanisme bevat het mRNA een sequentie dat met zichzelf kan paren en zo een haarspeldstructuur van 7 -20 basenparen vormt. Deze structuur is rijk aan cytosine-guanine basenparen. C-G basenparen hebben een duidelijke basestapelinginteractie (speciaal de G-C basenparen) en kunnen door hun drie waterstofbruggen een stabile RNA-duplex vormen, waardoor het stabieler is dan de DNA-RNA-hybride. Het resultaat is dat de DNA-RNA-hybride van 8 basenparen van het transcriptiecomplex overgaat in een 4basenpaar-hybride. Deze 4bp-hybride heeft een zwakke A-U (adenine-uracil)-basenparing, waardoor het v (nl)
- Внутренняя терминация, также ρ-независимая терминация, ро-независимая терминация (англ. Rho-independent termination), — механизм остановки транскрипции гена у прокариот. Суть этого механизма такова: мРНК содержит гуанин-цитозин-обогащённую последовательность, которая может образовывать структуры типа шпилька в 7—20 пар оснований в длину. Гуанин и цитозин образуют друг с другом три водородные связи и поэтому связаны довольно прочно. Сразу после шпильки располагается участок, обогащённый урацилом. Связи между урацилом и аденином очень слабы. Белок, связанный с РНК-полимеразой (nusA), настолько прочно связывается со шпилькой, что это вызывает временную остановку полимеразы и прекращение транскрипции. В этот момент полимераза располагается на полиурациловом участке последовательности. Слабые (ru)
|
