Movatterモバイル変換


[0]ホーム

URL:


About:ChIP-exo

An Entity of Type:Abstraction100002137,from Named Graph:http://dbpedia.org,within Data Space:dbpedia.org

ChIP-exo is a chromatin immunoprecipitation based method for mapping the locations at which a protein of interest (transcription factor) binds to the genome. It is a modification of the ChIP-seq protocol, improving the resolution of binding sites from hundreds of base pairs to almost one base pair. It employs the use of exonucleases to degrade strands of the protein-bound DNA in the 5'-3' direction to within a small number of nucleotides of the protein binding site. The nucleotides of the exonuclease-treated ends are determined using some combination of DNA sequencing, microarrays, and PCR. These sequences are then mapped to the genome to identify the locations on the genome at which the protein binds.

PropertyValue
dbo:abstract
  • سير عمل رقاقة- EXO:إن تشيب-اكسو هي طريقة تعتمد على الهيموغلوبين المناعي للكروماتين لرسم خرائط المواقع التي يرتبط فيها بروتين مهم (عامل النسخ) بالجينوم. إنه تعديل لبروتوكول ChIP-seq ، مما يحسن دقة مواقع الربط من مئات أزواج القواعد إلى زوج أساسي واحد تقريبًا. وهي تستخدم استخدام نوكليازات خارجية لتحلل خيوط الحمض النووي المرتبط بالبروتين في اتجاه 5'-3 'إلى عدد صغير من النيوكليوتيدات في موقع ربط البروتين. يتم تحديد النيوكليوتيدات من النهايات المعالجة بالخلايا الخارجية باستخدام مزيج من تسلسل الحمض النووي والمصفوفات الدقيقة و PCR. ثم يتم تعيين هذه التسلسلات للجينوم لتحديد المواقع على الجينوم الذي يرتبط فيه البروتين. (ar)
  • ChIP-exo is a chromatin immunoprecipitation based method for mapping the locations at which a protein of interest (transcription factor) binds to the genome. It is a modification of the ChIP-seq protocol, improving the resolution of binding sites from hundreds of base pairs to almost one base pair. It employs the use of exonucleases to degrade strands of the protein-bound DNA in the 5'-3' direction to within a small number of nucleotides of the protein binding site. The nucleotides of the exonuclease-treated ends are determined using some combination of DNA sequencing, microarrays, and PCR. These sequences are then mapped to the genome to identify the locations on the genome at which the protein binds. (en)
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 34858148 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 9546 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1123480926 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • ChIP-exo is a chromatin immunoprecipitation based method for mapping the locations at which a protein of interest (transcription factor) binds to the genome. It is a modification of the ChIP-seq protocol, improving the resolution of binding sites from hundreds of base pairs to almost one base pair. It employs the use of exonucleases to degrade strands of the protein-bound DNA in the 5'-3' direction to within a small number of nucleotides of the protein binding site. The nucleotides of the exonuclease-treated ends are determined using some combination of DNA sequencing, microarrays, and PCR. These sequences are then mapped to the genome to identify the locations on the genome at which the protein binds. (en)
  • سير عمل رقاقة- EXO:إن تشيب-اكسو هي طريقة تعتمد على الهيموغلوبين المناعي للكروماتين لرسم خرائط المواقع التي يرتبط فيها بروتين مهم (عامل النسخ) بالجينوم. إنه تعديل لبروتوكول ChIP-seq ، مما يحسن دقة مواقع الربط من مئات أزواج القواعد إلى زوج أساسي واحد تقريبًا. وهي تستخدم استخدام نوكليازات خارجية لتحلل خيوط الحمض النووي المرتبط بالبروتين في اتجاه 5'-3 'إلى عدد صغير من النيوكليوتيدات في موقع ربط البروتين. (ar)
rdfs:label
  • تشيب-إكسو (ar)
  • ChIP-exo (en)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:isPrimaryTopicOf
isdbo:wikiPageWikiLink of
isfoaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso   This material is Open Knowledge    W3C Semantic Web Technology    This material is Open Knowledge   Valid XHTML + RDFa
This content was extracted fromWikipedia and is licensed under theCreative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License

[8]ページ先頭

©2009-2025 Movatter.jp