前作『アナザーコード 2つの記憶』にて父親・リチャードと再会したアシュレイ。それから3年の時が経った、アシュレイ・16歳の8月。新たに勤め始めた研究所で多忙を極め、半年も家に帰っていない父に、アシュレイは溝を感じるようになっていた。そんなある日、リチャードに呼び出され、アシュレイは「ジュリエット・レイク」の湖畔にあるキャンプ場に赴くことになる。そのキャンプ場で、アシュレイは幼い頃の母の記憶に触れ、その謎に迫っていくことになる。