「この世に、神々の力及ばざる時、妖魔をもって、妖魔を討つ。公儀妖怪討伐士、榊咲夜！！」
宝永4年（1707）。人心の荒廃、御政道の乱れによって、霊峰・富士が噴火を開始。神々の結界は破られ、地の底より悪しき妖怪達が地上に溢れ出た！その妖怪を討ち倒すことが出来るのは、妖刀・村正のみ。しかし、その刀には妖怪を討つ度に、使い手の魂を喰らうという秘密があった。17歳にして妖怪討伐士となり、村正の所有者となった榊咲夜は、幕府の密命を受け、討伐行に旅立つ。その行く手には、妖怪達との壮絶な死闘が待ち受けていた！