言わずと知れた人気野球ゲームのメイン5作目。N64パワプロとしては2作目。
これまでは実在プロ球団2軍編だったが、本作は高校野球編。それに伴ってイベントも彼女候補のバリエーションも増えた。
当時あったプロ野球脱税事件に関与していた疑惑がある選手は収録されていない（後に攻略本などでパスワードを発表して対応）
本作『5』までは後のパワポケシリーズを作ったメンバーが開発に関わっていた。そのため初代『パワプロクンポケット』は本作の外伝・後日談であり、世界観を共有しているなど共通点が多い。