高校生・天宮晴輝の住む町は、ある日突然、人を襲う“保菌者”によって埋め尽くされてしまった…。蠢く大量の“保菌者”から逃げ切れるのか!? 絶望的サバイバル、開幕! 変わり果てた人間が町を襲い、変わり果てた町が人を阻む!! いつもの道を、命を懸けて駆け抜けろ!

敵の攻撃により衆議院と議員会館が崩壊。国会議員は金平光圀ただ一人が残される。それでも天宮螢は、万年野党議員の金平を目覚めさせ総理へと押し上げた。一方、秋保では隔離地域脱出への作戦が進められていた。新型の羽虫型に感染したながみ。衛星電話を盗んだ幹部クラスの裏切り者。不安要素が積み重なる中、作戦決行の日が近づく…。