《决战萨斯城》是以微观领域为题材的魔幻、悬疑、科幻类的长篇卡通故事。作品充满魔幻色彩。故事展开的背景，不是人们熟悉的宏观人类的大千世界，也不是一般科幻作品中常见的外星球，而是人类凭肉眼根本无法看见的微观世界。在微观世界里，细菌类、真菌类和病毒类已幻化成具有人类外在形态的拟人形——尽管是千奇百怪、形态各异的拟人形。代表正义力量的基因山小伯爵和童子军，他们与微观世界形形色色的邪恶拟人形，尤其是以萨斯王和侏儒萨为代表的病毒拟人形，展开了激烈的斗争，演绎出了一幕幕既波澜壮阔又扑朔迷离、充满神秘色彩的魔幻好戏。