ゲームの進み方は前作『スーパーマリオランド3 ワリオランド』とほぼ同じで、作中でのワリオは探検帽を被っており、変身する種類も前作とほぼ能力が同じでブルワリオ・ジェットワリオ（イーグルワリオ）・ドラゴンワリオ（シードラゴンワリオ）・チビワリオであるが、本作では3種の能力全てを強化された状態で使える「キングドラゴンワリオ」にも変身できる。『ワリオランド』の爽快アクションはそのままに、バーチャルボーイの「デュアルディスプレイシステム」によって独特の奥行き感が冒険の進展を盛り上げている。なお、このゲームは出荷数が少なかったために入手困難で、ゲーム店では小売価格以上の値段で販売されている場合がある。