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本漫画主角(赤脚阿元)与父母,胞姊,胞弟同住广岛市,他们爱好和平,但是无辜受到小男孩之害。

1945年(昭和20年)8月6日,美军以原子弹轰炸广岛,当时居住在原爆中心附近的阿元一家,两名男孩因到学校上学而避过一劫,阿元的母亲与胞姊死于原子弹的高温下,父亲则下落不明。

《赤脚阿元》是一部自传作品，漫画中有许多情节都来自中泽启治的实际经验，不过也有与实际经验不同的部分。例如原子弹投下时，阿元是小学二年级，而中泽启治经历当时为小学一年级；而原爆发生后，中泽本身并没有亲自目睹父亲、姐姐和弟弟的死（而是听当时在场的母亲转述）；此外，中泽启治也没有亲眼见证母亲的死（不像漫画中是在战后不久过世，而是战后20年后，中泽启治当时人在东京）等等。

不过母亲火葬时没有留下遗骨这件事，不仅是真实发生的情节，也是个重要的契机，让中泽启治决定动笔画下以广岛原爆为主题的漫画。

故事后期则描写终战好几年后的战后情况，内容除了对昭和天皇、美军及美国、警察预备队（后来的陆上自卫队）等等进行批判，也相当着墨于原爆日后留下的伤痕。

基于一些时代考证的错误或极左派的主张，确实有对本作内容、表现手法等抱持其他意见的声音。不过《赤脚阿元》确实是作者中泽启治根据自己的实际经验，将原爆的悲剧、当时的时代背景、时代氛围传达出来，同时是兼具娱乐性质的一部作品，在国内外都相当受到好评，更曾改编为电影、戏剧、动画、音乐剧、绘本、说书等等。根据goo于2010年6月的调查，受选于“希望大家阅读的日本史漫画排行版”第一名[1]。

单行本及文库本的累积发行量，已超过1000万本。面对于维也纳召开、2007年5月50日开始的第一届不扩散核武器条约（NPT）检讨会议，日本政府代表团决定将《赤脚阿元》的英文版送给签约国。日本外务省接受了出版社给的30本英文版，据说此后会朝“漫画外交”发展。